偏硼酸模拟求助-偏硼酸团簇聚集

wgg1181543722 · 发表于 Post on 2022-10-14 22:19:23

本帖最后由 wgg1181543722 于 2022-10-14 22:26 编辑

体系：偏硼酸分子与水分子
力场：amber99sb-ildn.ff力场
请问各位老师，按照http://sobereva.com/soft/Sobtop/里的方法，产生了偏硼酸分子的力场文件，电荷采用的是RESP2，模拟结束后，偏硼酸分子发生了聚集，这是什么原因导致的呢

Frozen-Penguin · 发表于 Post on 2022-10-14 23:32:44

偏硼酸溶于水变为硼酸，amber力场和gaff力场应该体现不了这种变化

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[GROMACS] 偏硼酸模拟求助-偏硼酸团簇聚集

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