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[新手求助] 求助晶体参与的催化反应计算问题

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各位老师好,我制备了一个双金属复合催化剂,并测定了它的晶体结构,现在我得到这个催化剂的晶胞结构之后,想要去计算在一个晶胞上它的催化反应过程的吉布斯自由能,请问高斯里可以做到吗?之前我只用高斯做过一些小分子反应的计算,但是对于只得到了晶胞结构的周期性体系我不太清楚怎么写输入文件,如果高斯可以的做到话我的gjf文件应当怎么正确设置关键词和自旋多重度呢?

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发表于 Post on 2022-11-9 15:12:51 | 只看该作者 Only view this author
建议用专门做周期性计算的程序(VASP、QE等),高斯的周期性计算功能是鸡肋,实际计算没人用
Zikuan Wang
山东大学光学高等研究中心 研究员
BDF(https://bdf-manual.readthedocs.io/zh_CN/latest/Introduction.html)、ORCA(https://orcaforum.kofo.mpg.de/index.php)开发团队成员
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ORCID: https://orcid.org/0000-0002-4540-8734
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发表于 Post on 2022-11-9 15:46:52 | 只看该作者 Only view this author
把体系截图给出来,根据具体特征,别人才方便告诉你是否适合用Gaussian结合簇模型来计算,以及如果适合,怎么处理边界得当。也可以用CP2K作为周期性体系研究,100%没问题。

北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2022-11-9 16:34:59 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2022-11-9 15:46
把体系截图给出来,根据具体特征,别人才方便告诉你是否适合用Gaussian结合簇模型来计算,以及如果适合,怎 ...

sob老师您好,这是我的晶胞cif文件结构,请问这样的结构是否可以通过您说的利用Gaussian结合簇模型来计算呢?如果可以的话应该怎么去处理边界呢?

G0MZX7CIAROVM(M2FFRP]IC.png (166.47 KB, 下载次数 Times of downloads: 9)

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发表于 Post on 2022-11-9 16:38:50 | 只看该作者 Only view this author
whitemouse 发表于 2022-11-9 09:34
sob老师您好,这是我的晶胞cif文件结构,请问这样的结构是否可以通过您说的利用Gaussian结合簇模型来计算 ...

这种强相关体系,估计用什么软件都很难算准。
可以用簇模型算,但是不是因为适合用簇模型,而是其他计算方法都和簇模型一样不适用,只能从很多差方法里挑一个不那么差的。
边界建议仿照https://pubs.acs.org/doi/10.1021/acs.inorgchem.9b00994的方法,用赝势处理和QM区直接相连的环境原子,再外面的原子用点电荷描述。
Zikuan Wang
山东大学光学高等研究中心 研究员
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ORCID: https://orcid.org/0000-0002-4540-8734
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2022-11-9 16:55:22 | 只看该作者 Only view this author
wzkchem5 发表于 2022-11-9 16:38
这种强相关体系,估计用什么软件都很难算准。
可以用簇模型算,但是不是因为适合用簇模型,而是其他计算 ...

谢谢老师回复!我去研究一下

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