packmol运行水球和十二烷基磺酸钠的inp文件时报错

wjwh · 发表于 Post on 2023-1-20 11:34:23

各位大佬，我是个小白，正在学习使用packmol。如第一幅图所示，在练习sob老师的packmol例子时，在第四个例子上遇到了困难（前面的例子都成功了）。我是严格按照老师的inp编写内容重复的，唯一不同的时sob老师在定义原子的时候是atoms42和atoms1，而我的是atoms3和atoms38（因为我自己画出来的原子对应的是3和38）。但是在packmol运行中出现了如下第二张截图的报错。尝试在手册里寻找报错原因，但是没太理解？希望得到解决办法。因为借助这个十二烷基磺酸钠的例子模型我可以构建其它正负离子化合物的模型。谢谢大家，第一次发帖，有不妥的地方请指正。

Jotaro · 发表于 Post on 2023-1-21 23:36:32

文件传上来测试一下

dadapeng · 发表于 Post on 2024-5-17 17:13:52

wjwh老师你好，我最近刚接触packmol，请问您的inp文件是怎么建立的，需要用到什么特殊的软件吗？

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[综合交流] packmol运行水球和十二烷基磺酸钠的inp文件时报错