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[VASP] 求助:大家有没有按顺序提交vasp任务的脚本

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楼主
求助:大家有没有按顺序提交vasp任务的脚本。我不想一直盯着电脑

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2023-3-14 16:36:22 | 只看该作者 Only view this author
vasp算完一个,接着算下一个,不用我管

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发表于 Post on 2023-3-14 16:40:32 | 只看该作者 Only view this author
Use work load manager, such as slurm, open PBS.

Or use bash script, for loop.
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电邮: ask@hpc4you.top

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发表于 Post on 2023-3-14 16:49:14 | 只看该作者 Only view this author
wPV 发表于 2023-3-14 16:36
vasp算完一个,接着算下一个,不用我管

有别人回复之前若需要对帖子进行修改、补充,应直接编辑原帖,不要通过回帖进行补充,这点在置顶的新社员必读贴里明确说了。
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
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发表于 Post on 2023-3-15 11:01:24 | 只看该作者 Only view this author
我是自己写shell脚本,grep到OUTCAR里面结束时候的某段文字时就提交下一个任务

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发表于 Post on 2023-3-15 11:41:31 | 只看该作者 Only view this author
两种方法,一种是挨个队列提交任务,至于脚本得看你使用的是哪种PBS了
第二种就是写个简单的shell脚本,把vasp的文件夹按顺序命名
for i in {1..9}
do
cd ../$i
mpirun -np XX vasp_std
done

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发表于 Post on 2023-3-15 18:51:02 | 只看该作者 Only view this author
sun35mr 发表于 2023-3-15 11:41
两种方法,一种是挨个队列提交任务,至于脚本得看你使用的是哪种PBS了
第二种就是写个简单的shell脚本,把 ...

您好,第二种方法是一次全部提交9个任务吗?

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发表于 Post on 2023-3-16 08:53:18 | 只看该作者 Only view this author
jing@lll 发表于 2023-3-15 18:51
您好,第二种方法是一次全部提交9个任务吗?

理论上没有限制数目,你也可以试试
for i in XX
do
cd ./$i
mpirun -np vasp_std
cd ../
done
但还是建议用PBS提交

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发表于 Post on 2024-10-28 16:17:35 | 只看该作者 Only view this author
sun35mr 发表于 2023-3-16 08:53
理论上没有限制数目,你也可以试试
for i in XX
do

请问一下,这些命令,是一行打出来吗?如下面这样:
for i in XX; do cd ./$i; mpirun -np vasp_std; cd ../; done

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