计算化学公社

 找回密码 Forget password
 注册 Register
Views: 712|回复 Reply: 1
打印 Print 上一主题 Last thread 下一主题 Next thread

[VASP] dimer找完过渡态之后的振动方向不是我预期的,这是为什么

[复制链接 Copy URL]

20

帖子

0

威望

231

eV
积分
251

Level 3 能力者

我使用vasp做过渡态经验<二>:Dimer - 第一性原理 (First Principle) - 计算化学公社 (keinsci.com)该帖子给的方法寻找过渡态。我给出一个初猜结构,计算频率,虚频显示 ,413.081281 cm-1虚频对应的振动模式是我设想的该反应发生的成键方向,于是我使用413.081281 cm-1的振动频率制作了MODECAR,dimer之后,再次验证虚频的时候,唯一虚频对应的振动方向 竟然是初猜结构的225.127914 cm-1(即上图的倒数第二行)。和我预期的过渡态成键方式不一样,请问各位大佬出现过这种情况吗?该如何解释?

202304121538399285..png (12.58 KB, 下载次数 Times of downloads: 7)

202304121538399285..png

125

帖子

0

威望

2170

eV
积分
2295

Level 5 (御坂)

2#
发表于 Post on 2023-4-12 17:11:07 | 只看该作者 Only view this author
正常,特别是初始结构不太好的时候。
如果结构是自己随手搭的,考虑按照你给的帖子里的做法,先跑个粗糙的CI-NEB。
如果已经这么做了,考虑在CI-NEB计算中尽量多地固定反应区域外的原子,可以固定全部表面原子。低精度的计算有时会较大程度影响表面结构。也可以考虑适当增加CI-NEB计算的精度。

本版积分规则 Credits rule

手机版 Mobile version|北京科音自然科学研究中心 Beijing Kein Research Center for Natural Sciences|京公网安备 11010502035419号|计算化学公社 — 北京科音旗下高水平计算化学交流论坛 ( 京ICP备14038949号-1 )|网站地图

GMT+8, 2024-11-27 01:34 , Processed in 0.214684 second(s), 24 queries , Gzip On.

快速回复 返回顶部 返回列表 Return to list