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[新手求助] dushin计算Huang-Rhys求助

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各位老师好,我按照Sob老师的帖子使用Dushin分解重组能和计算Huang-Rhys因子对磷光铂配合物的Huang-Rhys进行了计算,但是在out文件中没有"Displacement: in terms of nc of 1 THEN of nc of 2"的输出,也就是说out文件中没有位移在正则坐标上的分量Q,每个正则模式对重组能的贡献量lam这些数据,请问这个问题应该怎么解决呢?
dushin.dat内容如下:
1 2   'curvilinear and atom reordering flags'


2 1 's0 freq'  'Pt-1-pbe0-freq-s0.log'
0 1 't1 freq'  'Pt-1-pbe0-freq-t1.log'



dushin.out文件见附件,,谢谢老师~~

pt1dushin.out

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发表于 Post on 2016-7-1 12:00:09 | 只看该作者 Only view this author
感觉你的输入文件有问题,dushin的结果完全异常,数据净是0。最好先把文中例子做一下熟悉基本操作。
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
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发表于 Post on 2016-7-1 12:39:30 | 只看该作者 Only view this author
屏幕输出是什么? 这个out文件包含的信息不够。 但是大概可以看 Dushinsky matrix有问题。

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2016-7-1 18:18:01 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2016-7-1 12:00
感觉你的输入文件有问题,dushin的结果完全异常,数据净是0。最好先把文中例子做一下熟悉基本操作。

谢谢sob老师的回复~~您文中的例子我之前操作过,而且自己也算过一个含有过渡金属的配合物,能跑出来~~这次用的命令和之前的一样,高斯计算的输入文件命令:#P PBE1PBE/gen pseudo=read freq 在用dushin跑的时候log文件中的这些命令识别不了,一直报错~~所以在高斯计算好的log文件中我把命令这一块
改成了:#P freq b3lyp/def2svp  log文件在附件中,麻烦您再给看一下,谢谢~~

Pt-2-pbe0-freq-t1.log

563.76 KB, 下载次数 Times of downloads: 23

Pt-2-pbe0-freq-s0.log

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dushin.dat

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2016-7-1 18:20:02 | 只看该作者 Only view this author
yjmaxpayne 发表于 2016-7-1 12:39
屏幕输出是什么? 这个out文件包含的信息不够。 但是大概可以看 Dushinsky matrix有问题。

谢谢您的回复~~我把计算过程中的输出粘出来了,我不清楚您要的是不是这个~~麻烦您看一下,谢谢啦

屏幕输出.out

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发表于 Post on 2016-7-2 02:25:35 | 只看该作者 Only view this author
没看出是因为什么导致的问题。
dushin输入文件里第一行Curvilinear flag和atom reorderd flag设成别的试试。
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2016-7-2 09:50:55 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2016-7-2 02:25
没看出是因为什么导致的问题。
dushin输入文件里第一行Curvilinear flag和atom reorderd flag设成别的试试 ...

恩恩,好的,我再试试看~~谢谢sob老师

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发表于 Post on 2019-8-3 20:29:42 | 只看该作者 Only view this author
请问楼主问题解决了吗?我也遇到了相同的情况,如果解决了麻烦您指点一二~

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2019-8-31 17:08:58 | 只看该作者 Only view this author
shyshy 发表于 2019-8-3 20:29
请问楼主问题解决了吗?我也遇到了相同的情况,如果解决了麻烦您指点一二~

当时记得好像是因为DUSHIN程序的原因,需要手动在一个文件(应该是log文件)中改一下泛函(或者基组)。不好意思啊,时间太久了,我记不清了。。。

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发表于 Post on 2021-12-2 18:24:54 | 只看该作者 Only view this author
shyshy 发表于 2019-8-3 20:29
请问楼主问题解决了吗?我也遇到了相同的情况,如果解决了麻烦您指点一二~

你好,我这也遇到了相同问题,请问你那解决了吗?求教

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