计算化学公社

 找回密码 Forget password
 注册 Register
Views: 1169|回复 Reply: 3
打印 Print 上一主题 Last thread 下一主题 Next thread

[新手求助] 关于水的明尼苏达描述符求教

[复制链接 Copy URL]

223

帖子

1

威望

1227

eV
积分
1470

Level 4 (黑子)

跳转到指定楼层 Go to specific reply
楼主
各位前辈好!因为想用Gaussian搞一个H2O和DMF混合溶剂的隐式溶剂,来给纳米粒子做结构优化,
去查了明尼苏达溶剂描述符数据库,欣喜的发现H2O和DMF都有,但是H2O的部分参数不全,我想这可能是根据参数的定义,比如既不能说水是酸也不能说它是碱,所以这里的酸碱度就不太好表示。
那么这里是否可以认为是0呢?或者说用0这个值是否有问题?对于表面张力,我换算出来大概在100,能否放进去用呢?
最后是想根据DMF和H2O的体积比来做加权,得到混合溶剂的SMD参数。
所以现在很困扰,能不能这样搞一下???
还请各位前辈不吝赐教啊!


1万

帖子

0

威望

9855

eV
积分
22090

Level 6 (一方通行)

2#
发表于 Post on 2023-4-21 22:56:36 | 只看该作者 Only view this author
可以考虑用PCM来做结构优化(此时可以定义水/DMF混合溶剂),并且挑一个结构做纯水、纯DMF的SMD单点计算,和同样结构下纯水、纯DMF计算的PCM单点结果对比,证明对于纯水和纯DMF而言PCM和SMD的结果都是足够接近的,因此水/DMF混合溶剂的PCM结果也理应和SMD结果接近,从而绕开SMD不好定义水和非水溶剂的混合溶剂的问题
Zikuan Wang
山东大学光学高等研究中心 研究员
BDF(https://bdf-manual.readthedocs.io/zh_CN/latest/Introduction.html)、ORCA(https://orcaforum.kofo.mpg.de/index.php)开发团队成员
Google Scholar: https://scholar.google.com/citations?user=XW6C6eQAAAAJ
ORCID: https://orcid.org/0000-0002-4540-8734
主页:http://www.qitcs.qd.sdu.edu.cn/info/1133/1776.htm
GitHub:https://github.com/wzkchem5
本团队长期招收研究生,有意者可私信联系

223

帖子

1

威望

1227

eV
积分
1470

Level 4 (黑子)

3#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2023-4-22 02:01:03 | 只看该作者 Only view this author
wzkchem5 发表于 2023-4-21 22:56
可以考虑用PCM来做结构优化(此时可以定义水/DMF混合溶剂),并且挑一个结构做纯水、纯DMF的SMD单点计算, ...

万分感谢前辈!

223

帖子

1

威望

1227

eV
积分
1470

Level 4 (黑子)

4#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2023-4-22 02:06:37 | 只看该作者 Only view this author
wzkchem5 发表于 2023-4-21 22:56
可以考虑用PCM来做结构优化(此时可以定义水/DMF混合溶剂),并且挑一个结构做纯水、纯DMF的SMD单点计算, ...

前辈您好,我还想问一下,这里考虑用PCM在自定义混合溶剂下做OPT计算的话,我在Gaussian输入文件末尾,结构坐标后面空了一行输入

eps=XXX
epsinf=XXX

Dis
Rep
Cav


这样是合适的么?

本版积分规则 Credits rule

手机版 Mobile version|北京科音自然科学研究中心 Beijing Kein Research Center for Natural Sciences|京公网安备 11010502035419号|计算化学公社 — 北京科音旗下高水平计算化学交流论坛 ( 京ICP备14038949号-1 )|网站地图

GMT+8, 2026-2-18 22:08 , Processed in 0.172911 second(s), 20 queries , Gzip On.

快速回复 返回顶部 返回列表 Return to list