计算化学公社

 找回密码 Forget password
 注册 Register
Views: 587|回复 Reply: 4
打印 Print 上一主题 Last thread 下一主题 Next thread

[CP2K] cp2k做激发时遇到内存的无效引用问题怎么解决?

[复制链接 Copy URL]

14

帖子

0

威望

329

eV
积分
343

Level 3 能力者

各位老师好,附件是我用cp2k做激发950个态的输入文件。900个态是正常的,950个态是900的输入文件改激发态的个数为950算的,出现截图这种错误。
想问一下:是输入文件的问题还是950太大了算不了的问题呢?或者是其他没注意的问题,机器内存还有,我算950之前也将之前的结果进行了清理。

微信图片_20230531122858.png (73.01 KB, 下载次数 Times of downloads: 5)

微信图片_20230531122858.png

微信图片_20230531122850.png (109.87 KB, 下载次数 Times of downloads: 2)

微信图片_20230531122850.png

td-nbocl2.inp

22.91 KB, 下载次数 Times of downloads: 2

2301

帖子

1

威望

5475

eV
积分
7796

Level 6 (一方通行)

2#
发表于 Post on 2023-5-31 17:44:29 | 只看该作者 Only view this author
你又没说,怎么编译的,
用什么编译器,哪一个MPI?

给这个图片,能猜出什么来……

好多版本的MPI,都存在问题,
写在cp2k讨论组,以及Intel MPI论坛,都有提及……

最稳定的是Intel 2018.4.
OneAPI,可能会遇到问题。
High-Performance Computing for You
为您专属定制的高性能计算解决方案

更多讯息,请访问:
https://labitc.top
http://tophpc.top:8080
电邮: ask@hpc4you.top

5万

帖子

99

威望

5万

eV
积分
112381

管理员

公社社长

3#
发表于 Post on 2023-6-1 04:18:14 | 只看该作者 Only view this author
大概率是内存不够
如果空余内存还有富裕,把MAX_MEMORY设得更大。如果没有富裕,减小MPI进程数从而令MAX_MEMORY能设得更大
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
欢迎加入“北京科音”微信公众号获取北京科音培训的最新消息、避免错过网上有价值的计算化学文章!
欢迎加入人气非常高、专业性特别强的综合性理论与计算化学交流QQ群“思想家公社QQ群”:1号:18616395,2号:466017436,3号:764390338,搜索群号能搜到哪个说明目前哪个能加,合计9000人。北京科音培训班的学员在群中可申请VIP头衔,提问将得到群主Sobereva的最优先解答。
思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大的量子化学波函数分析程序)
ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu
Money and papers are rubbish, get a real life!

14

帖子

0

威望

329

eV
积分
343

Level 3 能力者

4#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2023-6-1 15:05:20 | 只看该作者 Only view this author
好的,非常感谢老师

14

帖子

0

威望

329

eV
积分
343

Level 3 能力者

5#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2023-6-1 15:08:49 | 只看该作者 Only view this author
abin 发表于 2023-5-31 17:44
你又没说,怎么编译的,
用什么编译器,哪一个MPI?

非常感谢老师的回复,我是刚开始接触,编译这个我也不太清楚。我的输入文件是multiwfn做的,这个机器是组里装的,我刚开始使用。抱歉您的问题我也会注意,我再问问组里其他人

本版积分规则 Credits rule

手机版 Mobile version|北京科音自然科学研究中心 Beijing Kein Research Center for Natural Sciences|京公网安备 11010502035419号|计算化学公社 — 北京科音旗下高水平计算化学交流论坛 ( 京ICP备14038949号-1 )|网站地图

GMT+8, 2024-11-25 07:38 , Processed in 0.164597 second(s), 23 queries , Gzip On.

快速回复 返回顶部 返回列表 Return to list