genmer-gaussian软件生成团簇的初始构型，怎么对其进行切面，扩胞操作？

1159042428 · 发表于 Post on 2023-8-28 09:59:18

想要补充一部分数据，想要做一个金属晶体表面吸附有机物，首先通过genmer-gaussian生成金属团簇的最稳定初始构型，求助怎么对其进行（1.1.1）表面，并进行扩胞操作？

sobereva · 发表于 Post on 2023-8-28 11:22:45

切晶面是对于已有的bulk状态的晶体结构而言的。比如你有Pt的晶胞的cif文件，然后可以通过GaussView等程序切晶面。而你这是团簇，没有对它切晶面的概念。顶多是说一个较大的团簇，里面的某一个面对应某个晶面。

1159042428 · 发表于 Post on 2023-8-28 11:28:00

sobereva 发表于 2023-8-28 11:22
切晶面是对于已有的bulk状态的晶体结构而言的。比如你有Pt的晶胞的cif文件，然后可以通过GaussView等程序切 ...

sob老师，那我这个团簇能用来做吸附吗？是不是有点小？例如吸附一个苯，O2等？不做吸附的话做一个金属催化的过渡态能行吗？

sobereva · 发表于 Post on 2023-8-28 15:53:31

1159042428 发表于 2023-8-28 11:28
sob老师，那我这个团簇能用来做吸附吗？是不是有点小？例如吸附一个苯，O2等？不做吸附的话做一个金属催 ...

如果你用团簇模型代替金属表面，显然簇太小了，边界效应太强
该用什么样的簇看下文的例子
使用量子化学程序基于簇模型计算金属表面吸附问题
http://sobereva.com/540（http://bbs.keinsci.com/thread-16532-1-1.html）

1159042428 · 发表于 Post on 2023-8-28 20:52:26

谢谢，sob老师

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[综合交流] genmer-gaussian软件生成团簇的初始构型，怎么对其进行切面，扩胞操作？