计算化学公社

 找回密码 Forget password
 注册 Register
Views: 729|回复 Reply: 4
打印 Print 上一主题 Last thread 下一主题 Next thread

[Gaussian/gview] 使用Gaussian计算一个铵根离子与周围环绕五个水分子的LUMO HOMO基组与泛函选择问题

[复制链接 Copy URL]

22

帖子

0

威望

121

eV
积分
143

Level 2 能力者

跳转到指定楼层 Go to specific reply
楼主
本帖最后由 LHY1999LHY 于 2023-9-26 22:01 编辑

大家好,最近需要用Gaussian 09W C.01 9.0计算一个单独的水分子、一个铵根离子与周围环绕五个水分子,这两个状态下水的LUMO HOMO,查阅了一些文献和浏览了一些帖子后,决定使用M06-2X  def2-TZVP进行结构优化和单点能的计算 ,溶剂选择SMD的水,不知道选择的泛函和基组是否合理,如果不合理,有没有更合适的。当计算一个铵根离子与周围环绕五个水分子这个体系时,和计算单个分子一样,画出一个铵根和五个水,进行结构优化和计算前需要做构象搜索吗?谢谢大家

1万

帖子

0

威望

7393

eV
积分
18146

Level 6 (一方通行)

2#
发表于 Post on 2023-9-27 00:45:28 | 只看该作者 Only view this author
没问题
需要做构象搜索,但这个体系几乎肯定已经有人算过了,如果能查到之前文献构象搜索搜出来的最稳定构象,那可以跳过构象搜索,直接取文献构象做结构优化
BDF(https://bdf-manual.readthedocs.io/zh_CN/latest/Introduction.html)、ORCA(https://orcaforum.kofo.mpg.de/index.php)开发团队成员

5万

帖子

99

威望

5万

eV
积分
112354

管理员

公社社长

3#
发表于 Post on 2023-9-27 04:22:06 | 只看该作者 Only view this author
这个叫做团簇的构型搜索不叫构象搜索,构象搜索是对于分子内部结构而言的
优化、振动分析用B3LYP-D3(BJ)/6-311G**足矣,用def2-TZVP太贵,用M06-2X则更容易出烦人的小虚频、难收敛,而且还比B3LYP-D3(BJ)更贵。此过程推荐用scrf关键词默认的IEFPCM
算能量时用你说的这个级别没问题
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
欢迎加入“北京科音”微信公众号获取北京科音培训的最新消息、避免错过网上有价值的计算化学文章!
欢迎加入人气非常高、专业性特别强的综合性理论与计算化学交流QQ群“思想家公社QQ群”:1号:18616395,2号:466017436,3号:764390338,搜索群号能搜到哪个说明目前哪个能加,合计9000人。北京科音培训班的学员在群中可申请VIP头衔,提问将得到群主Sobereva的最优先解答。
思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大的量子化学波函数分析程序)
ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu
Money and papers are rubbish, get a real life!

22

帖子

0

威望

121

eV
积分
143

Level 2 能力者

4#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2023-9-27 08:27:44 | 只看该作者 Only view this author
wzkchem5 发表于 2023-9-27 00:45
没问题
需要做构象搜索,但这个体系几乎肯定已经有人算过了,如果能查到之前文献构象搜索搜出来的最稳定构 ...

好的,谢谢您

22

帖子

0

威望

121

eV
积分
143

Level 2 能力者

5#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2023-9-27 08:28:31 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2023-9-27 04:22
这个叫做团簇的构型搜索不叫构象搜索,构象搜索是对于分子内部结构而言的
优化、振动分析用B3LYP-D3(BJ)/6 ...

好的,谢谢您

本版积分规则 Credits rule

手机版 Mobile version|北京科音自然科学研究中心 Beijing Kein Research Center for Natural Sciences|京公网安备 11010502035419号|计算化学公社 — 北京科音旗下高水平计算化学交流论坛 ( 京ICP备14038949号-1 )|网站地图

GMT+8, 2024-11-24 02:56 , Processed in 0.212338 second(s), 21 queries , Gzip On.

快速回复 返回顶部 返回列表 Return to list