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[Gaussian/gview] 请问有催化剂参与的反应在gview中如何构建?

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楼主
各位老师,请教一下:我的反应是有催化剂参与的,请问在gview中,是直接将催化剂分子添加到反应物中吗?那如何体现出催化剂的作用呢?

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发表于 Post on 2023-11-1 04:37:47 | 只看该作者 Only view this author
画出催化循环,然后依次算其中的每一步基元反应。只知道反应物、产物和催化剂结构,不知道机理的话,是没法做计算的。
BDF(https://bdf-manual.readthedocs.io/zh_CN/latest/Introduction.html)、ORCA(https://orcaforum.kofo.mpg.de/index.php)开发团队成员

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2023-11-1 08:52:28 | 只看该作者 Only view this author
wzkchem5 发表于 2023-11-1 04:37
画出催化循环,然后依次算其中的每一步基元反应。只知道反应物、产物和催化剂结构,不知道机理的话,是没法 ...

您好,机理已经知道了,所以说,我只需要把催化剂分子加入到每一步的结构中,无论是过渡态还是中间产物,都直接去算就行是吗?我不清楚要不要在哪里设置一下,从而体现一下结构中这部分是催化剂;还有就是如果我构建势能面的话,最初的能量为0的地方,应该是反应物加催化剂的能量吧?如果是这样的话,是不是要单独算一下催化剂的单点能?

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发表于 Post on 2023-11-1 10:30:06 | 只看该作者 Only view this author
SMALL-CR7 发表于 2023-11-1 08:52
您好,机理已经知道了,所以说,我只需要把催化剂分子加入到每一步的结构中,无论是过渡态还是中间产物, ...

既然已经知道了催化循环,那就把催还循环的每一步单独作为一个步骤去算就可以。
不需要在其中体现谁是催化剂,因为催化循环的一个基元步骤里看不出谁是催化剂

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2023-11-1 10:32:08 | 只看该作者 Only view this author
Yaocy 发表于 2023-11-1 10:30
既然已经知道了催化循环,那就把催还循环的每一步单独作为一个步骤去算就可以。
不需要在其中体现谁是催 ...

好的,谢谢老师

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2023-11-1 10:44:54 | 只看该作者 Only view this author
老师们,我还想问一下,如果想通过理论计算对比一下有催化剂在和无催化剂时反应的难易程度,该用什么思路呢?

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发表于 Post on 2023-11-1 17:15:34 | 只看该作者 Only view this author
SMALL-CR7 发表于 2023-11-1 03:44
老师们,我还想问一下,如果想通过理论计算对比一下有催化剂在和无催化剂时反应的难易程度,该用什么思路呢 ...

分别列出有催化剂和无催化剂时的反应机理,分别计算每一步基元反应,按http://bbs.keinsci.com/thread-14313-1-1.html的方法分别计算有催化剂和无催化剂时的表观自由能垒,然后看哪个高
BDF(https://bdf-manual.readthedocs.io/zh_CN/latest/Introduction.html)、ORCA(https://orcaforum.kofo.mpg.de/index.php)开发团队成员

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2023-11-1 19:34:19 | 只看该作者 Only view this author
wzkchem5 发表于 2023-11-1 17:15
分别列出有催化剂和无催化剂时的反应机理,分别计算每一步基元反应,按http://bbs.keinsci.com/thread-14 ...

谢谢老师

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