mdrun提示负载不平衡

zhangfaxue · 发表于 Post on 2023-12-14 18:06:42

体系设置：A\B\C三个分子，用packmol建模，周期性边界，想观察界面现象；能量最小化；npt mdrun后出现如下提示
1、这是需要对计算过程使用的线程等进行分配吗？请问有什么好的方法处理，但是他只是note，是不是不管他也不会影响最终结果的准确性？
2、结果分析后本来想观察油水界面，但是变成油滴，请问这样应该怎么处理？

想要这样的界面效果:AC界面上B的现象

我得到的结果：A充满体系各个位置，BC变成一团(总而言之，我要的油水界面变成了水中的油滴）

呀芽芽 · 发表于 Post on 2024-1-26 08:53:04

你好，请问你解决了吗？负载不平衡影响最后的结果吗？我也遇到了负载不平衡提示，但是没报错。

Graphite · 发表于 Post on 2024-1-27 13:22:18

这个算例不均衡度倒也不高。负载不均衡不影响计算结果，只影响计算耗时。

zhangfaxue · 发表于 Post on 2024-2-29 13:55:01

呀芽芽发表于 2024-1-26 08:53
你好，请问你解决了吗？负载不平衡影响最后的结果吗？我也遇到了负载不平衡提示，但是没报错。

不影响结果，只是影响计算速度，所以最后我没管他

zhangfaxue · 发表于 Post on 2024-2-29 13:55:23

Graphite 发表于 2024-1-27 13:22
这个算例不均衡度倒也不高。负载不均衡不影响计算结果，只影响计算耗时。

好的，谢谢老师

		自动登录 Automatic login	找回密码 Forget password
密码 Password			注册 Register

[GROMACS] mdrun提示负载不平衡

浏览过的版块