求助cp2k计算电子密度和Hartree势在VMD显示不正常的问题

海鸥 · 发表于 Post on 2023-12-30 23:31:02

本帖最后由海鸥于 2023-12-30 23:35 编辑

老师您好，我用cp2k计算了电子密度和Hartree势，然后把cube文件导入vmd中显示，我在确定色彩刻度范围的时候，根据【使用Multiwfn+VMD快速地绘制静电势着色的分子范德华表面图和分子间穿透图（含视频演示） - 思想家公社的门口：量子化学·分子模拟·二次元 (sobereva.com)】这个帖子的方法，在Multiwfn中找最大最小值，结果都是0，我不确定是不是我的计算，还是哪方面的问题（因为我一提交计算，这些文件立马就生成了哎），麻烦辛苦老师看看，非常感谢
老师；cube文件太大，我传到网盘，如果有需要的话，辛苦麻烦老师下载看看，谢谢老师！
链接：https://pan.baidu.com/s/1v57FSwyDbEJrSZCGB6p2hw?pwd=0717
提取码：0717

MoS2_mem_single.inp (3.11 KB, 下载次数 Times of downloads: 0)

test.out (27.96 KB, 下载次数 Times of downloads: 0)

sobereva · 发表于 Post on 2023-12-31 10:53:43

Multiwfn此功能目前不支持周期性体系，而且本来也不是这么用的，cube文件根本不包含波函数信息
当前电子密度等值面数值设得看起来明显偏大，而不是常用的0.001 a.u.

海鸥 · 发表于 Post on 2023-12-31 22:47:25

sobereva 发表于 2023-12-31 10:53
Multiwfn此功能目前不支持周期性体系，而且本来也不是这么用的，cube文件根本不包含波函数信息
当前电子密 ...

谢谢老师！我去调节一下等值面

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