Uni-Retro｜一键式药物小分子逆合成分析工具

farfarcheng

逆合成分析，也称作逆合成法、反合成分析，是解决有机合成[1]路线的重要方法，也是有机合成路线设计的最基本的方法。其实质是目标分子的分拆，通过分析目标分子结构，逐步将其拆解为更简单、更容易合成的前体和原料，从而完成路线的设计。

有机合成路线设计对分子合成意义重大，优秀的合成路线反应步骤少，反应简单，原料便宜，相对差的路线不仅费时费力，甚至可能合成到一半发现某步反应无法实现。正确而优美的有机合成路线设计是一个非常具有挑战性的任务,针对反应路线设计的难点体现在几个方面:

1. 具有挑战性的繁复有机反应决策需要研究者经过系统的有机化学知识的学习和操作经验积累，比如考量多种官能团对反应性的影响。

2. 反应原料难以被全面考虑。现有的数万种、数十万种原料对于人类而言过于庞大，就算是合成专家也只能了解其中一小部分，其它的只能凭自己经验去分析可能存在再去原料库去搜索。同时每年都有大量新的商业化原料出现，原有的原料也会有价格波动与下架。

因此，在快速发展的计算机辅助药物设计（CADD）领域中，合成路线的合理设计至关重要。

为了更好地解决上述问题，我们结合行业领先的自研 NAG2G[2] 单步逆合成算法，推出了 Uni-Retro，综合了数据库查询、相似反应生成、反应模版以及多套 AI 系统，使用全新的搜索框架，为用户提供了一套便捷的自动化逆合成分析工具。用户输入待合成分子，即可一键生成多条合成路线，为有机合成提供有力支持。（https://arxiv.org/abs/2309.15798）

Uni-Retro@Apps

为了方便大家快速设计有机合成路线，Uni-Retro 已在 Bohrium Apps 上线，限时免收取 license fee 一个月。下面，我们简单介绍一下 Uni-Retro App 的使用流程：

1. 打开：https://app.bohrium.dp.tech/retro-synthesis/workbench/

2.  新建合成项目，并输入待合成分子，根据自身需求，调整运行参数（可选），点击 Start Exploration

3. 运行结束后，查看路线

4. 点击 Candidate Routes，查看更多路线

5. 如果认为单步反应需要修改，点击 Alternative Reactions 并选中分子，在下方会出现其它推荐反应

下面是 Uni-Retro 设计出的一些合成路线示例：

• 药物分子 Tirabrutinib
  
  

• 天然产物 Naamidine
  
  
  

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