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[新手求助] 求助碳正离子和双键碳相连的过渡态优化结果异常

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本帖最后由 起个名字特难丶 于 2024-1-20 08:52 编辑

反应机理(由g到h):


优化关键词 # opt=(calcfc,ts,noeigen) freq 6-31+g(d,p) m062x  , 1  1 。
优化的结果:

结果有且只有一个虚频,但是并不是11号碳和18号碳相连的虚频。我已经调整初猜结构重新计算有十几次了,但是每次优化的结果都是这样。有没有老师可以给出一些初猜结构的建议,谢谢了 g-h.gjf (3.22 KB, 下载次数 Times of downloads: 2)


IRC的结果如下:

仅仅是12号碳的旋转,并没有11号碳和18号碳相连的过程。

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发表于 Post on 2024-1-19 20:53:41 | 只看该作者 Only view this author
跑一下IRC试试。
虽然11号碳和18号碳最后会相连,但是并不意味着分子从过渡态的初速度也是沿着让它们相连的方向走的。找过渡态就好比你从A坐飞机到C,在B转机,然后飞机从B起飞了,你要判断你有没有坐错飞机。看虚频等于是你看飞机是不是朝着C起飞的,走IRC等于是等飞机飞了一半或者开始降落了再看目的地对不对。显然前者更快但错误率高,后者更慢但错误率低。
BDF(https://bdf-manual.readthedocs.io/zh_CN/latest/Introduction.html)、ORCA(https://orcaforum.kofo.mpg.de/index.php)开发团队成员

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2024-1-19 21:10:51 | 只看该作者 Only view this author
wzkchem5 发表于 2024-1-19 20:53
跑一下IRC试试。
虽然11号碳和18号碳最后会相连,但是并不意味着分子从过渡态的初速度也是沿着让它们相连 ...

谢谢老师,我这就去试一试

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2024-1-20 08:51:16 | 只看该作者 Only view this author
wzkchem5 发表于 2024-1-19 20:53
跑一下IRC试试。
虽然11号碳和18号碳最后会相连,但是并不意味着分子从过渡态的初速度也是沿着让它们相连 ...

IRC的结果就是只有12号碳的旋转,并没有形成碳碳键的过程

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发表于 Post on 2024-1-20 15:40:10 | 只看该作者 Only view this author
起个名字特难丶 发表于 2024-1-20 01:51
IRC的结果就是只有12号碳的旋转,并没有形成碳碳键的过程

优化IRC的端点结构以后也没有成键吗
BDF(https://bdf-manual.readthedocs.io/zh_CN/latest/Introduction.html)、ORCA(https://orcaforum.kofo.mpg.de/index.php)开发团队成员

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2024-1-20 16:05:03 | 只看该作者 Only view this author
wzkchem5 发表于 2024-1-20 15:40
优化IRC的端点结构以后也没有成键吗

优化出的11号碳和18号碳之间的键长,最小为1.69793(左端点),最大为1.70705(右端点)。并没有观察到他们成键的过程,仅仅是12号碳原子自己在旋转。

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发表于 Post on 2024-1-20 18:49:25 | 只看该作者 Only view this author
可能过渡态更偏反应物,结构也跟反应物更类似,可以尝试把C11-C18键长增大至2.0埃以上
或者从反应物或产物做一个柔性扫描

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2024-1-21 09:05:38 | 只看该作者 Only view this author
sai77 发表于 2024-1-20 18:49
可能过渡态更偏反应物,结构也跟反应物更类似,可以尝试把C11-C18键长增大至2.0埃以上
或者从反应物或产物 ...

谢谢老师,我去试一下

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