MS构建amorphous cell时，如何确保所建结构中包含氢键

luoshaotian · 发表于 Post on 2024-1-22 13:42:23

如图所示，假设水杨酸与三聚氰胺通过氢键连接。在建立amorphous cell的过程中，我手动将距离限制在3.5A以内，假使它形成了如图所示的氢键。之后通过ms的amorphous cell tool将它构建为amorphous结构。但在几何优化过程中，N O之间的距离被改变，使之大于4A，理论上不存在氢键。想请问，我如何才能确保氢键确实存在呢？这种建模方式是否正确？

chenzhe · 发表于 Post on 2024-1-23 10:57:54

氢键是靠后续分子动力学稳定后统计的，就算你这样加进去，分子动力学一算也不是这样，完全没必要。直接单组分放进去就是了

		自动登录 Automatic login	找回密码 Forget password
密码 Password			注册 Register

[Material Studio] MS构建amorphous cell时，如何确保所建结构中包含氢键

浏览过的版块