计算化学公社

 找回密码 Forget password
 注册 Register
Views: 944|回复 Reply: 1
打印 Print 上一主题 Last thread 下一主题 Next thread

[CP2K] NPT_I跑分子体系盒子越来越大

[复制链接 Copy URL]

9

帖子

0

威望

372

eV
积分
381

Level 3 能力者

使用cp2k的NPT_I跑一个液体体系(见附件),.inp脚本使用Multiwfn生成,经过10ps的NVT后,发现跑NPT总是避免不了盒子爆炸,这个密度按理来说不是很高,调试了很久不知道为什么,望大家指点。

MgTFSI2_DME.zip

3.92 MB, 下载次数 Times of downloads: 25

*pos.xyz记录了NPT前1000fs的路径,盒子在加速的膨胀直到无法计算

6万

帖子

99

威望

6万

eV
积分
125151

管理员

公社社长

2#
发表于 Post on 2024-2-7 06:40:58 | 只看该作者 Only view this author
.inp叫输入文件不叫脚本
描述分子间相互作用,PBE显然得加D3校正
加了D3如果还这样,减小压浴的TIMECON或降低温度再试。当前体系分子间相互作用很弱,常温下也可能是气态的
另外,我不知道你用NPT的目的何在,如果想让盒子自发减小,得到分子结合到一起的状态,此时体系的分子数明显太少,最终得到的凝聚状态的盒子尺寸也会明显太小,会存在严重的与镜像的相互作用,导致体系特征和动力学行明显不合理

评分 Rate

参与人数
Participants 1
eV +5 收起 理由
Reason
vantasyoscar + 5 とてもいい!

查看全部评分 View all ratings

北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
欢迎加入北京科音微信公众号获取北京科音培训的最新消息,并避免错过网上有价值的计算化学文章!
欢迎加入人气极高、专业性特别强的理论与计算化学综合交流群思想家公社QQ群(群号见此链接),合计达一万多人。北京科音培训班的学员在群中可申请VIP头衔,提问将得到群主Sobereva的最优先解答。
思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大、极为流行的量子化学波函数分析程序)
Google Scholar:https://scholar.google.com/citations?user=tiKE0qkAAAAJ
ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu

本版积分规则 Credits rule

手机版 Mobile version|北京科音自然科学研究中心 Beijing Kein Research Center for Natural Sciences|京公网安备 11010502035419号|计算化学公社 — 北京科音旗下高水平计算化学交流论坛 ( 京ICP备14038949号-1 )|网站地图

GMT+8, 2026-2-23 06:44 , Processed in 0.166162 second(s), 24 queries , Gzip On.

快速回复 返回顶部 返回列表 Return to list