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[新手求助] 求助审稿意见中提到能量保留小数的问题

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审稿人提出一个问题是:I doubt the energetics of the electronic structure calculations are accurate to the first decimal point. The accuracy should be around 8 or 10 kJmol-1? This accuracy has to be stated. Therefore, all energies given should be rounded.
我个人理解是他认为我计算出的结构的能量需要保留8至十位小数?然后如果我保留一位就需要说明这种准确性?这是我个人理解,因为我看到的文章大多都是直接保留了一位小数,并且好像都是默认四舍五入,所以我不知道这种情况该怎么说明自己保留一位小数的科学性?希望大佬给点意见。

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发表于 Post on 2024-2-19 09:40:29 | 只看该作者 Only view this author
这句话说的是你能量都给到了一位小数(猜想你文章里用的是kj/mol),但是你的计算精度达不到0.1kj/mol的精度。这样的话是不是应该四舍五入,只保留整数部分。

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发表于 Post on 2024-2-19 10:04:21 | 只看该作者 Only view this author
好奇你是如何理解出“能量需要保留8至十位小数”这个观点的?

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发表于 Post on 2024-2-19 11:09:32 | 只看该作者 Only view this author

好奇你是如何理解出“能量需要保留8至十位小数”这个观点的?

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发表于 Post on 2024-2-19 14:18:19 | 只看该作者 Only view this author
自觉把单位说清楚,最关键的都不说
通常情况下,以Hartree为单位,能量保留五位小数,kJ/mol或kcal/mol保留一位小数,一方面是习俗,一方面是目前主流计算级别精度原因
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
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思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大、极为流行的量子化学波函数分析程序)
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2024-2-19 18:44:54 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2024-2-19 14:18
自觉把单位说清楚,最关键的都不说
通常情况下,以Hartree为单位,能量保留五位小数,kJ/mol或kcal/mol保 ...

谢谢老师,我用的是kj/mol,请问老师关于计算精度是否有文献对这些方法和基组进行了研究呢?

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2024-2-19 18:45:39 | 只看该作者 Only view this author
paramecium86 发表于 2024-2-19 09:40
这句话说的是你能量都给到了一位小数(猜想你文章里用的是kj/mol),但是你的计算精度达不到0.1kj/mol的精 ...

对的,我用的是kj/mol,我看sob老师之前有个帖子说一般默认是保留一位。

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2024-2-19 18:47:55 | 只看该作者 Only view this author
yuelth 发表于 2024-2-19 10:04
好奇你是如何理解出“能量需要保留8至十位小数”这个观点的?

抱歉,我的英文水平有限,The accuracy should be around 8 or 10 kJmol-1?这句话我有点不太理解,我以为这里说的精度是指有效数字。这里难道指的是要我保留到整数8或者10吗。比如我之前是8.2,那我就是8kj/mol

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2024-2-19 18:48:37 | 只看该作者 Only view this author
Strange 发表于 2024-2-19 11:09
好奇你是如何理解出“能量需要保留8至十位小数”这个观点的?

抱歉,我的英文水平有限,The accuracy should be around 8 or 10 kJmol-1?这句话我有点不太理解,我以为这里说的精度是指有效数字。这里难道指的是要我保留到整数8或者10吗。比如我之前是8.2,那我就是8kj/mol吗?

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发表于 Post on 2024-2-19 18:54:18 | 只看该作者 Only view this author
胆小鬼 发表于 2024-2-19 18:44
谢谢老师,我用的是kj/mol,请问老师关于计算精度是否有文献对这些方法和基组进行了研究呢?

谈谈量子化学研究中什么样的benchmark才有意义
http://sobereva.com/554http://bbs.keinsci.com/thread-17826-1-1.html
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发表于 Post on 2024-2-20 09:41:17 | 只看该作者 Only view this author
胆小鬼 发表于 2024-2-19 18:48
抱歉,我的英文水平有限,The accuracy should be around 8 or 10 kJmol-1?这句话我有点不太理解,我以为 ...

我的理解是说你的误差在8-10kj/mol左右,或者要你保留到8到10.如果你算的数据确实是8.x,10.x,那可能是后一种。但其实KJ保留到小数点后一位也还好吧,感觉是正常做法,不过被审稿人说了也没办法

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发表于 Post on 2024-2-28 22:22:28 | 只看该作者 Only view this author
既然对精度有怀疑,尝试一下用较小的单位来表达能量?例如电子伏。比如1hatree大约等于27eV。

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发表于 Post on 2024-2-29 12:46:50 | 只看该作者 Only view this author
保留一位小数就够了吧

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发表于 Post on 2024-3-25 15:44:21 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2024-2-19 14:18
自觉把单位说清楚,最关键的都不说
通常情况下,以Hartree为单位,能量保留五位小数,kJ/mol或kcal/mol保 ...

想请教一下sob老师,以eV为单位的话,能量可以保留几位小数呢

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发表于 Post on 2024-3-25 16:57:42 | 只看该作者 Only view this author
gejuqing 发表于 2024-3-25 08:44
想请教一下sob老师,以eV为单位的话,能量可以保留几位小数呢

一般保留两位的比较多
Zikuan Wang
山东大学光学高等研究中心 研究员
BDF(https://bdf-manual.readthedocs.io/zh_CN/latest/Introduction.html)、ORCA(https://orcaforum.kofo.mpg.de/index.php)开发团队成员
Google Scholar: https://scholar.google.com/citations?user=XW6C6eQAAAAJ
ORCID: https://orcid.org/0000-0002-4540-8734
主页:http://www.qitcs.qd.sdu.edu.cn/info/1133/1776.htm
GitHub:https://github.com/wzkchem5
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