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[CASTEP/Dmol3/MS] 想请教一下各位,CIF文件在MS中不正常显示以及UNSTALE问题

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本帖最后由 ch3r 于 2024-3-12 11:09 编辑

请问一下各位,我有两个问题:
1.我是在CCDC下载的晶体结构,我导入MS后,发现无法正常显示,我检查了一下,并没有发现导入过程发生错误,请问该如何解决呢,如果MS解决不了是否有其余的软件能够做growth morphology(GM)的预测呢?2.还想请教一下大家,我在做别的化合物GM的预测时,发现我尝试了所有MS软件中的力场,均有不同的面出现UNSTALE的现象,无法生成有效的晶体结构。请问这种情况如何解决呢?


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)J8546BQPEIQ9}I(}~{DWRU.png

ameisu.cif

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发表于 Post on 2024-3-12 09:50:14 | 只看该作者 Only view this author
不要上来就不加描述地用“GM”这个不常见的缩写,没人准确知道你指的是什么。就算有其它程序能干相同的事别人也没法回答
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2024-3-12 11:08:12 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2024-3-12 09:50
不要上来就不加描述地用“GM”这个不常见的缩写,没人准确知道你指的是什么。就算有其它程序能干相同的事别 ...

收到社长,我立马更正以及以后尽量避免缩写

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发表于 Post on 2024-4-13 12:19:04 | 只看该作者 Only view this author
从ccdc导出的cif文件 氢原子的位置都非常不好 你可能的试试先把所有的氢删了 自动加氢或者优化一下氢的位置 然后再做morphology的模拟 我是这样解决了一系列晶面unstable的情况的。

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2024-8-1 13:50:47 | 只看该作者 Only view this author
KSeGaSn 发表于 2024-4-13 12:19
从ccdc导出的cif文件 氢原子的位置都非常不好 你可能的试试先把所有的氢删了 自动加氢或者优化一下氢的位置 ...

感谢回答,谢谢了

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