gromacs安装时SIMD instruction显示none怎么办？

qyl · 发表于 Post on 2024-4-2 15:36:12

gromacs安装时SIMD instruction显示none怎么办？

sobereva · 发表于 Post on 2024-4-3 18:07:40

不交代安装细节、安装的软硬件环境，没人能回答

qyl · 发表于 Post on 2024-4-4 11:13:10

sobereva 发表于 2024-4-3 18:07
不交代安装细节、安装的软硬件环境，没人能回答

这是服务器的信息：Linux amain 3.10.0-693.el7.x86_64 #1 SMP Tue Aug 22 21:09:27 UTC 2017 x86_64 x86_64 x86_64 GNU/Linux
安装时按照社长的步骤来的，但是amd不支持avx指令集

qyl · 发表于 Post on 2024-4-4 11:17:17

sobereva 发表于 2024-4-3 18:07
不交代安装细节、安装的软硬件环境，没人能回答

我把SIMD instructions改成了SSE4.1，但是RDTSCP usage: disabled，不知道这样有没有问题？
GROMACS version: 2018.8
Precision:       single
Memory model:    64 bit
MPI library:       thread_mpi
OpenMP support:    enabled (GMX_OPENMP_MAX_THREADS = 64)
GPU support:       disabled
SIMD instructions:  SSE4.1
FFT library:       fftw-3.3.8-sse2-avx-avx2-avx2_128
RDTSCP usage:    disabled
TNG support:       enabled
Hwloc support:    disabled
Tracing support: disabled
Built on:          2024-04-02 06:34:49
Built by:          root@amain [CMAKE]
Build OS/arch:    Linux 3.10.0-693.el7.x86_64 x86_64
Build CPU vendor: Unknown
Build CPU brand: Unknown
Build CPU family: 0 Model: 0 Stepping: 0
Build CPU features: Unknown
C compiler:       /usr/bin/cc GNU 4.8.5
C compiler flags: -msse4.1    -O2 -DNDEBUG -funroll-all-loops -fexcess-precision=fast
C++ compiler:    /usr/bin/c++ GNU 4.8.5
C++ compiler flags:  -msse4.1 -std=c++11 -O2 -DNDEBUG -funroll-all-loops -fexcess-precision=fast

sobereva · 发表于 Post on 2024-4-4 16:52:59

qyl 发表于 2024-4-4 11:17
我把SIMD instructions改成了SSE4.1，但是RDTSCP usage: disabled，不知道这样有没有问题？
GROMACS v ...

不用管

amain我不清楚。如果是在虚拟机里编译的，识别不出来CPU型号很正常

qyl · 发表于 Post on 2024-4-4 16:59:57

sobereva 发表于 2024-4-4 16:52
不用管

amain我不清楚。如果是在虚拟机里编译的，识别不出来CPU型号很正常

这个是的服务器上安装的，我直接安装的gmx2018.8这个版本的gromacs

白浪滔天 · 发表于 Post on 2024-5-1 18:22:56

请问楼主这个问题解决了吗？

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