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[新手求助] 关于对苯二酚自氧化机理的计算

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之前在论坛搜索相关内容时,看到老师建议谷歌搜索对苯二酚氧化得到相关材料,看了好几篇文献,对于对苯二酚到苯醌之间的转化都是比较定性的
想请教各位老师,关于这块内容-H,-e的反应过程,能否计算它的能垒?


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发表于 Post on 2024-4-15 04:33:54 | 只看该作者 Only view this author
-H可以,就是和O2的H转移,-e没法按一般方式算
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2024-4-15 17:53:09 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2024-4-15 04:33
-H可以,就是和O2的H转移,-e没法按一般方式算

谢谢sob老师,我在计算和O2的H转移过程中遇到了一些问题,本来是想和图上一样,O2移走OH上的H,结果过渡态和IRC跑完,发现O2加到了苯环上面,和预期的H转移差的有点多。我在计算的时候先采用的是B3LYP/6-31G(d,p),也尝试过加一两个显式水分子,但是效果都不太好,大部分情况都是氧气远离苯环,没有和羟基上的氢相互靠近。想请教一下sob老师,遇到这种情况,还有哪些方便搜索H转移过渡态的方法

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发表于 Post on 2024-4-15 20:58:40 | 只看该作者 Only view this author
说明应该换个反应途径。很可能是O2夺走碳上的氢,然后酚基氧的电子向碳转移,氢离子电离到显式溶剂上。有可能是单重态反应。

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发表于 Post on 2024-4-15 22:35:43 | 只看该作者 Only view this author
用B3LYP-D3(BJ)/def2-SVP算了一下,三线态氧对对苯二酚夺取氢原子,是能够找到过渡态的,其中的一个过渡态的IRC在附件中。 mq4.zip (276.41 KB, 下载次数 Times of downloads: 8)

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2024-4-15 22:39:33 | 只看该作者 Only view this author
wjc404 发表于 2024-4-15 22:35
用B3LYP-D3(BJ)/def2-SVP算了一下,三线态氧对对苯二酚夺取氢原子,是能够找到过渡态的,其中的一个过渡态 ...

谢谢老师,我研究一下这个过渡态

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2024-4-16 18:05:43 | 只看该作者 Only view this author
wjc404 发表于 2024-4-15 22:35
用B3LYP-D3(BJ)/def2-SVP算了一下,三线态氧对对苯二酚夺取氢原子,是能够找到过渡态的,其中的一个过渡态 ...

老师,按照这个过渡态作为初猜,用我使用的基组搜索,确实也找到了过渡态,虚频和振动方向也是符合预期的,但是我想计算这个过渡态的单点能时却遇到了无法收敛的情况真的每一步都好难

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