关于Y6衍生物如何选取合适的端对π-π堆积模式

renyutong · 发表于 Post on 2024-5-20 10:56:43

老师们好，最近在研究关于Y6及其修改端基后的衍生物性质不同的理论计算，选取相同分子进行端对π-π模式后，对于端基衍生物的堆积犯了难。参照组选用的堆积模式如下文件1，参照组分子结构如图1，衍生物分子结构如图2。参照组选取端基苯环进行堆积。相对于参照组而言，衍生物在端基多了一个苯环。是应该和参照组相同选取噻吩下的苯环进行堆积，还是选取最下面的呢？恳请老师们进行批评指正

sobereva · 发表于 Post on 2024-5-21 02:56:18

看不懂你想要做什么

如果要得到最理想的二聚体结构，对这种又很大又很柔的体系适合用gromacs跑分子动力学得到

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[分子对接] 关于Y6衍生物如何选取合适的端对π-π堆积模式