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[GROMACS] 求助gromacs对石墨烯和电解液体系做能量最小化域分解报错

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在计算石墨烯和电解液体系的过程中出现了域分解的报错,做了一些尝试仍然没有解决,求大佬指教。
情况如下:
1.首先使用packmol构建了电极电解液的体系
2.能量最小化过程中出现了域分解的报错
3.由于要保持界面不动,因此将石墨烯原子坐标固定

尝试:1.使用-ntmpi 1 未能解决
         2.使用gromacs-2021版本没有报错,但换到gromacs-2023版本就会出现这样的报错;在2023版本中,去掉石墨烯之后的纯电解液是不会报错的,加上石墨烯就报错。
         3.报错显示是石墨烯上的335和336号原子相互作用导致的
         4.增大盒子尺寸为5nm之后,仍然报错,且要求的最小盒子尺寸也增加到了7nm,同样是由于石墨烯上的两个原子相互作用导致的


结构.png (385.03 KB, 下载次数 Times of downloads: 11)

体系结构

体系结构

报错 gro.png (130.46 KB, 下载次数 Times of downloads: 11)

报错+gro

报错+gro

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