计算化学公社

 找回密码 Forget password
 注册 Register
Views: 497|回复 Reply: 2
打印 Print 上一主题 Last thread 下一主题 Next thread

[GROMACS] 如何将rmsf.xvg文件中的横坐标从原子编号改为氨基酸残基编号?

[复制链接 Copy URL]

297

帖子

0

威望

529

eV
积分
826

Level 4 (黑子)

老师们好,我使用gmx rmsf命令生成了rmsf.xvg文件,并在电脑使用qtgrace 将文件可视化,如下图

但是该如何将横坐标改为氨基酸残基编号呢,就像下面我从文献里截取的图片,是我所期望得到的

251

帖子

0

威望

430

eV
积分
681

Level 4 (黑子)

A Student

2#
发表于 Post on 2024-6-29 17:52:37 | 只看该作者 Only view this author
From the manual of gmx rmsf https://manual.gromacs.org/current/onlinehelp/gmx-rmsf.html
Yet to be strong in theory, yet to have enough practical skills.
Still I am having fun with MD simulation.

297

帖子

0

威望

529

eV
积分
826

Level 4 (黑子)

3#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2024-6-29 18:01:50 | 只看该作者 Only view this author
student0618 发表于 2024-6-29 17:52
From the manual of gmx rmsf https://manual.gromacs.org/current/onlinehelp/gmx-rmsf.html

谢谢老师!

本版积分规则 Credits rule

手机版 Mobile version|北京科音自然科学研究中心 Beijing Kein Research Center for Natural Sciences|京公网安备 11010502035419号|计算化学公社 — 北京科音旗下高水平计算化学交流论坛 ( 京ICP备14038949号-1 )|网站地图

GMT+8, 2024-11-27 22:52 , Processed in 1.335923 second(s), 24 queries , Gzip On.

快速回复 返回顶部 返回列表 Return to list