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[新手求助] 关于冠醚与水的氢键作用该如何计算

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各位老师好,我目前想算一个类似15冠醚的结构与几个水形成的团簇最稳定,也看了一些大佬们的帖子,但大部分类似的帖子配体数目已知,或是很大的团簇(如石墨烯),但对于这种配体数目未知的情况,应该采用什么方法,或是如何设定模型?
目前本人能想到的就是分别算结合不同水分子数的结构,选出能量最低的,但是感觉不是很靠谱,烦请各位大佬拨冗指点,谢谢!

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发表于 Post on 2024-7-3 14:34:03 | 只看该作者 Only view this author
你研究这个的目的,是为了研究特定压强下气相里15冠醚结合几个水分子?还是为了研究水溶液里对15冠醚做显式溶剂化需要加几个水分子?
Zikuan Wang
山东大学光学高等研究中心 研究员
BDF(https://bdf-manual.readthedocs.io/zh_CN/latest/Introduction.html)、ORCA(https://orcaforum.kofo.mpg.de/index.php)开发团队成员
Google Scholar: https://scholar.google.com/citations?user=XW6C6eQAAAAJ
ORCID: https://orcid.org/0000-0002-4540-8734
主页:http://www.qitcs.qd.sdu.edu.cn/info/1133/1776.htm
GitHub:https://github.com/wzkchem5
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2024-7-3 15:04:40 | 只看该作者 Only view this author
wzkchem5 发表于 2024-7-3 14:34
你研究这个的目的,是为了研究特定压强下气相里15冠醚结合几个水分子?还是为了研究水溶液里对15冠醚做显式 ...

老师您好,是为了研究该冠醚作为催化剂对水的耐受性,溶液环境不是水,只是想计算这个结构最多能结合几个水分子,从而推出对水的耐受极限

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发表于 Post on 2024-7-3 16:18:54 | 只看该作者 Only view this author
我真的算不明白 发表于 2024-7-3 08:04
老师您好,是为了研究该冠醚作为催化剂对水的耐受性,溶液环境不是水,只是想计算这个结构最多能结合几个 ...

这里的问题在于(1)即使知道了能结合几个水,也不知道需要加多少浓度的水才能结合这么多水,因为冠醚和水的结合是平衡,不是不可逆反应;(2)因为是平衡,所以即使结合水的冠醚分子远多于没结合水的冠醚分子,也未必意味着不耐受;(3)反过来讲,也可能结合第一个水分子就已经不耐受了,研究能不能结合第二个水未必和耐受性有关系。
所以建议重新评估一下,研究结合几个水分子是否能得到关于你说的耐受性的结论,然后再做计算
Zikuan Wang
山东大学光学高等研究中心 研究员
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2024-7-3 17:00:07 | 只看该作者 Only view this author
wzkchem5 发表于 2024-7-3 16:18
这里的问题在于(1)即使知道了能结合几个水,也不知道需要加多少浓度的水才能结合这么多水,因为冠醚和 ...

老师您好,是我之前的描述有问题,这个冠醚催化剂是用于聚合反应的,因为一般来讲水的存在会影响聚合,但在该催化体系下已经通过实验证明,加入一定的水不会影响聚合,我们猜测是由于冠醚与水之间存在氢键作用,相当于把水分子锁住,所以我想通过计算找到这样一个结构来对实验结果加以证明,至于具体的耐受量是不需要计算的
由于不知道冠醚和几个水分子结合最稳定,况且也不是水溶液体系,所以不知道从何下手
至于老师说的平衡反应,我的体系催化剂负载一般在0.05%以下,水的数目应该是远多于催化剂分子数的,所以才想算一下二者是怎样结合的
很抱歉之前描述有误 耽误了老师不必要的时间!

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发表于 Post on 2024-7-3 20:51:27 | 只看该作者 Only view this author
本帖最后由 wzkchem5 于 2024-7-3 13:52 编辑
我真的算不明白 发表于 2024-7-3 10:00
老师您好,是我之前的描述有问题,这个冠醚催化剂是用于聚合反应的,因为一般来讲水的存在会影响聚合,但 ...

既然水分子远多于催化剂分子,那么更说明冠醚不是通过锁住水来起作用的,因为冠醚不足以锁住你体系里的所有水。我觉得首先应该确定,在冠醚不存在的情况下,你的聚合体系对水的耐受度多高,可能也和冠醚存在时一样高。水会影响阳离子/阴离子/配位聚合没错,但是只有一部分这样的体系是只需要一当量水就完全死掉了,有的聚合体系对聚合活性种好几个当量的水都不敏感,例如alpha-氰基丙烯酸甲酯(502胶)甚至能在液态水的水面上聚合,水不仅不阻止聚合,反倒引发聚合。不能武断地认为聚合体系不怕水一定是因为你外加的物质起的作用
Zikuan Wang
山东大学光学高等研究中心 研究员
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2024-7-3 21:30:38 | 只看该作者 Only view this author
wzkchem5 发表于 2024-7-3 20:51
既然水分子远多于催化剂分子,那么更说明冠醚不是通过锁住水来起作用的,因为冠醚不足以锁住你体系里的所 ...

好的 我再仔细思考一下 谢谢老师!

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