计算化学公社

 找回密码 Forget password
 注册 Register
Views: 873|回复 Reply: 1
打印 Print 上一主题 Last thread 下一主题 Next thread

[CP2K] 用cp2k计算几何优化,计算前后原子序数发生变化的问题

[复制链接 Copy URL]

106

帖子

0

威望

649

eV
积分
755

Level 4 (黑子)

本帖最后由 THY 于 2024-7-7 15:52 编辑

小弟使用cp2k,用multiwfn将cif文件转为inp文件,并且途中将所有原子顺序按照Z轴排序,计算后,通过restart文件显示计算后的结构,发现原子序数发生改变,怎么解决?


初始结构.inp

12.96 KB, 下载次数 Times of downloads: 1

优化后-1.restart

17.21 KB, 下载次数 Times of downloads: 1

初始结构.cif

21.24 KB, 下载次数 Times of downloads: 0

6万

帖子

99

威望

6万

eV
积分
125127

管理员

公社社长

2#
发表于 Post on 2024-7-7 16:15:53 | 只看该作者 Only view this author
在Multiwfn主功能0里简单看了一眼inp和restart文件,没看到哪个原子序号有变化。CP2K自己不会重排序号
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
欢迎加入北京科音微信公众号获取北京科音培训的最新消息,并避免错过网上有价值的计算化学文章!
欢迎加入人气极高、专业性特别强的理论与计算化学综合交流群思想家公社QQ群(群号见此链接),合计达一万多人。北京科音培训班的学员在群中可申请VIP头衔,提问将得到群主Sobereva的最优先解答。
思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大、极为流行的量子化学波函数分析程序)
Google Scholar:https://scholar.google.com/citations?user=tiKE0qkAAAAJ
ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu

本版积分规则 Credits rule

手机版 Mobile version|北京科音自然科学研究中心 Beijing Kein Research Center for Natural Sciences|京公网安备 11010502035419号|计算化学公社 — 北京科音旗下高水平计算化学交流论坛 ( 京ICP备14038949号-1 )|网站地图

GMT+8, 2026-2-19 16:09 , Processed in 0.170220 second(s), 23 queries , Gzip On.

快速回复 返回顶部 返回列表 Return to list