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[Material Studio] 求助使用交联脚本交联后交联度未达到设定值并没有交联成网

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  各位老师好,求助一下交联脚本进行均三苯甲酸(100个)和哌嗪(150个)进行交联时最终交联度只有33.7%,没有达到设定的56%,并且结构也没有连成网,就几个零散的交联结构,只有两个到三个分子交联起来的长度,没好友达到交联成网状结构的效果,请问各位老老师可以怎样解决,交联脚本与交联前的cell结构(AC盒子)和交联单体monomer(均三苯甲酸)和交联剂xlinker(哌嗪)和交联后的结构xlink-final的的结构文件附在附件里了。谢谢各位老师。

202407081850362187..png (552.39 KB, 下载次数 Times of downloads: 29)

最终失败的交联结构图

最终失败的交联结构图

cell.xsd

1.9 MB, 下载次数 Times of downloads: 4

monomer.xsd

10.6 KB, 下载次数 Times of downloads: 5

xlink_final.xsd

2.39 MB, 下载次数 Times of downloads: 6

xLink-Condensation.pl

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xlinker.xsd

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发表于 Post on 2024-7-9 15:31:43 | 只看该作者 Only view this author
你试试改大一点交联的距离呢

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2024-7-9 23:16:20 | 只看该作者 Only view this author
Starrymoon 发表于 2024-7-9 15:31
你试试改大一点交联的距离呢

好的,谢谢您,我尝试一下

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2024-7-11 15:28:44 | 只看该作者 Only view this author
Starrymoon 发表于 2024-7-9 15:31
你试试改大一点交联的距离呢

您好,根据您的指导我增加了交联半径成功进行了交联,但是为什么交联之后AC盒子里出现了断键,请问您知道如何解决吗?

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