使用AutoDock Vina进行对接时，无法Choose配体

12313 · 发表于 Post on 2024-8-1 20:32:24

各位老师好，我的体系是蛋白配体复合物，配体是一小段多肽序列，我使用PoMOL根据序列生成的配体，进入AutoDockTools后，我通过Ligand列表中input的Choose选择配体，但是出现这样的报错，请问这种情况该怎么解决呢？

student0618 · 发表于 Post on 2024-8-1 21:43:46

Vina不适合作多肽对接的。

liangh36 · 发表于 Post on 2024-8-2 09:41:17

student0618 发表于 2024-8-1 21:43
Vina不适合作多肽对接的。

大佬，对于含非天然氨基酸的多肽，推荐使用什么进行对接呢

12313 · 发表于 Post on 2024-8-2 14:05:56

student0618 发表于 2024-8-1 21:43
Vina不适合作多肽对接的。

那适合多肽对接的工具有哪些呢老师？

香菜128 · 发表于 Post on 2024-10-31 16:01:57

student0618 发表于 2024-8-1 21:43
Vina不适合作多肽对接的。

0618老师你好 vina可以做蛋白和金属氧化物或者金属离子吗？

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[分子对接] 使用AutoDock Vina进行对接时，无法Choose配体