计算化学公社

 找回密码 Forget password
 注册 Register
Views: 162|回复 Reply: 3
打印 Print 上一主题 Last thread 下一主题 Next thread

[波函数分析求助] IRI散点图spike未达到最底部是什么原因呢

[复制链接 Copy URL]

52

帖子

0

威望

504

eV
积分
556

Level 4 (黑子)

同一个二聚体体系,两个不同的结合位点,第二个情况有spike没有到达最底部,能说明什么原因呢。


5万

帖子

99

威望

5万

eV
积分
112353

管理员

公社社长

2#
发表于 Post on 2024-9-3 12:01:13 | 只看该作者 Only view this author
始终结合等值面图理解各个spike的含义。光给出个散点图毫无意义,没人猜得出来是什么情况
下文里也明确说了
用Multiwfn+VMD做RDG分析时的一些要点和常见问题
http://sobereva.com/291http://bbs.keinsci.com/thread-1206-1-1.html
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
欢迎加入“北京科音”微信公众号获取北京科音培训的最新消息、避免错过网上有价值的计算化学文章!
欢迎加入人气非常高、专业性特别强的综合性理论与计算化学交流QQ群“思想家公社QQ群”:1号:18616395,2号:466017436,3号:764390338,搜索群号能搜到哪个说明目前哪个能加,合计9000人。北京科音培训班的学员在群中可申请VIP头衔,提问将得到群主Sobereva的最优先解答。
思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大的量子化学波函数分析程序)
ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu
Money and papers are rubbish, get a real life!

52

帖子

0

威望

504

eV
积分
556

Level 4 (黑子)

3#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2024-9-3 18:16:07 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2024-9-3 12:01
始终结合等值面图理解各个spike的含义。光给出个散点图毫无意义,没人猜得出来是什么情况
下文里也明确说 ...

收到,谢谢sob老师解答。还有一个问题,几个spike同属于vdW作用范围,spike对应横坐标值越负可以说明作用力越强吗

5万

帖子

99

威望

5万

eV
积分
112353

管理员

公社社长

4#
发表于 Post on 2024-9-4 11:39:00 | 只看该作者 Only view this author
关于时间DE 发表于 2024-9-3 18:16
收到,谢谢sob老师解答。还有一个问题,几个spike同属于vdW作用范围,spike对应横坐标值越负可以说明作用 ...

不能这么简单判断
一定要、必须要、绝对要结合等值面图,否则别人都不知道spike对应的作用特征,比如两个spike对应的作用的面积相差很多,那显然就不能光对比作用区域的电子密度判断强度。而且比如原子半径很大的离子的离子键作用区域也可能电子密度很小,spike位置接近0,但强度肯定比一般的范德华作用大得多。
光给出散点图根本什么用都没有
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
欢迎加入“北京科音”微信公众号获取北京科音培训的最新消息、避免错过网上有价值的计算化学文章!
欢迎加入人气非常高、专业性特别强的综合性理论与计算化学交流QQ群“思想家公社QQ群”:1号:18616395,2号:466017436,3号:764390338,搜索群号能搜到哪个说明目前哪个能加,合计9000人。北京科音培训班的学员在群中可申请VIP头衔,提问将得到群主Sobereva的最优先解答。
思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大的量子化学波函数分析程序)
ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu
Money and papers are rubbish, get a real life!

本版积分规则 Credits rule

手机版 Mobile version|北京科音自然科学研究中心 Beijing Kein Research Center for Natural Sciences|京公网安备 11010502035419号|计算化学公社 — 北京科音旗下高水平计算化学交流论坛 ( 京ICP备14038949号-1 )|网站地图

GMT+8, 2024-11-23 19:28 , Processed in 0.566396 second(s), 24 queries , Gzip On.

快速回复 返回顶部 返回列表 Return to list