gmx自带dssp导出dat数据绘图问题

一条空空的河 · 发表于 Post on 2024-9-13 20:47:40

如题，题主使用的是gmx2024.01版本，自带gmx dssp，使用指令为：gmx dssp -s md02.tpr -f md02_fit.xtc -o dssp.dat -num dssp.xvg -b 0 -e 100000 -tu ps 导出xvg文件默认为二级结构随时间变化图，如何将dat文件转化为目前常见的dssp结果图呢？感谢！

Kiteliberator · 发表于 Post on 2025-3-11 17:42:19

想知道您这个问题怎么解决的

remake · 发表于 Post on 2025-12-23 16:46:45

请问解决这个问题了吗，求教！

huchao · 发表于 Post on 2025-12-24 20:32:30

楼主您好，我在使用gmx dssp 遇到了同样的问题，生成的xvg和dat文件不知道该如何分析，请问您这解决了吗？

remake · 发表于 Post on 2025-12-29 10:27:03

https://github.com/Jerkwin/gmxtools?tab=readme-ov-file
其中的dssp2gp可用于dssp.dat的绘制

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[GROMACS] gmx自带dssp导出dat数据绘图问题