计算化学公社

 找回密码 Forget password
 注册 Register
Views: 85|回复 Reply: 2
打印 Print 上一主题 Last thread 下一主题 Next thread

[CP2K] CINEB计算初始任务计算10s后续增加到300s问题咨询

[复制链接 Copy URL]

39

帖子

0

威望

313

eV
积分
352

Level 3 能力者

跳转到指定楼层 Go to specific reply
楼主
各位老师们好! 关于CINEB问题有如下问题咨询:
  首次尝试关于CINEB计算问题的咨询,将初始结构和产物结构插点进行计算(共11个点)在双路8370C的服务器进行计算,由于内存不够分为了16核运行。
    NUMBER_OF_REPLICA 11 #The number of replica to use in the BAND
    NPROC_REP 16 #The number of processors to be used per replica

  为节省时间将k点选为221,Ti调整为SZV-MOLOPT-SR-GTH,开始计算任务时每个任务计算时间较快:
     9 Broy./Diag. 0.40E+00   11.9     1.61811616     -5950.7149574897 -7.22E+01

但后续时间出现了大幅度升高,后检查每个out文件均出现了这种情况:
     3 Broy./Diag. 0.40E+00  347.5     6.68469511     -4967.9918980453  5.59E+02

  请问老师们,出现这种情况的原因是什么;是计算过程中的正常情况吗;是否能通过调整来提高整体的计算速度?  (计算文件已添加至附件)

CINEB.rar

2.51 MB, 下载次数 Times of downloads: 0

计算输入文件和结果文件

5万

帖子

99

威望

5万

eV
积分
112354

管理员

公社社长

2#
发表于 Post on 2024-9-24 21:36:50 | 只看该作者 Only view this author
调整计算方式,尽量让所有NEB点同时跑。16核算11个点太诡异了
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
欢迎加入“北京科音”微信公众号获取北京科音培训的最新消息、避免错过网上有价值的计算化学文章!
欢迎加入人气非常高、专业性特别强的综合性理论与计算化学交流QQ群“思想家公社QQ群”:1号:18616395,2号:466017436,3号:764390338,搜索群号能搜到哪个说明目前哪个能加,合计9000人。北京科音培训班的学员在群中可申请VIP头衔,提问将得到群主Sobereva的最优先解答。
思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大的量子化学波函数分析程序)
ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu
Money and papers are rubbish, get a real life!

39

帖子

0

威望

313

eV
积分
352

Level 3 能力者

3#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2024-9-25 09:24:30 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2024-9-24 21:36
调整计算方式,尽量让所有NEB点同时跑。16核算11个点太诡异了

好的谢谢sob老师,因为运行内存不太够所以设置成了16核,设置成11核后同时跑11个点会由于内存不够报错。我尝试改成7个点来进行计算

本版积分规则 Credits rule

手机版 Mobile version|北京科音自然科学研究中心 Beijing Kein Research Center for Natural Sciences|京公网安备 11010502035419号|计算化学公社 — 北京科音旗下高水平计算化学交流论坛 ( 京ICP备14038949号-1 )|网站地图

GMT+8, 2024-11-23 22:34 , Processed in 0.798249 second(s), 24 queries , Gzip On.

快速回复 返回顶部 返回列表 Return to list