cp2k计算z方向的电荷密度分布，得到的cub文件和在wfn上面的密度差局部积分曲线不同

李思玫

cub文件显示电荷差分集中在中间的小分子上面，但是采用Multiwfn，载入密度差格点数据文件EDD.cub，然后进入主功能13，再进入子功能18，绘制局部积分曲线如图1所示，在基底上面也有电荷密度差分布，而且数值较大，从vesta直接观察EDD.cube文件，密度差分布在中间小分子上面（如图二），且isosurface值为0.02，数值也与Multiwfn绘制的局部积分曲线纵坐标不同。
不知道是什么原因导的两点：（1）数值范围vesta的isosurface值为0.02，Multiwfn绘制的局部积分曲线纵坐标范围是-4-3左右。
（2）vesta直接观察EDD.cube文件密度差分只显示在吸附小分子上面，Multiwfn绘制的局部积分曲线沿z方向分布时，两端处于基底坐标也有较大的密度差分

李思玫

补充一下：vesta里面的Isosurface值是0.02，原则上wfn上面做的z方向密度差分值范围不应该也是0.2左右吗，但是图1纵坐标范围是-5到3

sobereva

李思玫 发表于 2024-10-7 19:06
补充一下：vesta里面的Isosurface值是0.02，原则上wfn上面做的z方向密度差分值范围不应该也是0.2左右吗，但 ...

有别人回复之前若需要对帖子进行修改、补充，应直接编辑原帖，不要通过回帖进行补充，这点在置顶的新社员必读贴里明确说了。

仔细看下文，说清楚wfn指的是什么
计算化学中的一些常见不良写法和用词
http://sobereva.com/298（http://bbs.keinsci.com/thread-1358-1-1.html）
在网上求助计算化学问题的时候必须把问题描述得详细、具体、准确、清楚
http://sobereva.com/620（http://bbs.keinsci.com/thread-25787-1-1.html）

李思玫

sobereva 发表于 2024-10-8 03:38
有别人回复之前若需要对帖子进行修改、补充，应直接编辑原帖，不要通过回帖进行补充，这点在置顶的新社员 ...

感谢sob老师，我已经修改