MS的cif文件点击计算成键为什么还会有未成键的原子 MOF

勤劳的小蜜蜂 · 发表于 Post on 2024-10-29 23:48:20

如图是NH2-MIL-125(Ti)的cif文件，导入到MS中点击计算成键，仍然有红色未成键的氧原子是为什么

aaq2800 · 发表于 Post on 2024-10-30 08:20:36

图显示的成不成键都未必是真实成键，是否真正成键，要看键级分析，如果想显示更多，可以把键长阈值设大一点，我一般设为默认值的1.4倍左右

勤劳的小蜜蜂 · 发表于 Post on 2024-10-30 13:11:26

aaq2800 发表于 2024-10-30 08:20
图显示的成不成键都未必是真实成键，是否真正成键，要看键级分析，如果想显示更多，可以把键长阈值设大一点 ...

明白谢谢老师

John_Tao · 发表于 Post on 2024-10-30 13:50:41

MS里计算键不一定对的，你可以手动连。然后你苯环链接也不对，应该是有晶体学无序，应该一个苯环上只有一个NH2

shaozhenwu · 发表于 Post on 2024-10-30 20:44:33

这个可以自己连起来吧我记得

aaq2800 · 发表于 Post on 2024-10-31 08:11:41

对，为了看起来漂亮，可以手动把任意2个原子连接起来，先点一下那个 C，然后点一个原子，就是出现所谓的键，可以拉向任意一个原子，然后连接起来

勤劳的小蜜蜂 · 发表于 Post on 2024-10-31 13:47:52

John_Tao 发表于 2024-10-30 13:50
MS里计算键不一定对的，你可以手动连。然后你苯环链接也不对，应该是有晶体学无序，应该一个苯环上只有一个 ...

哦哦明白了他计算成键错了谢谢老师

摘星1005 · 发表于 Post on 2024-12-10 20:33:40

你好，能求一下那个NH2-MIL-125（Ti）的cif文件吗

勤劳的小蜜蜂 · 发表于 Post on 2024-12-11 14:12:35

摘星1005 发表于 2024-12-10 20:33
你好，能求一下那个NH2-MIL-125（Ti）的cif文件吗

晶体结构数据库cod里面下载的

MINGYAOLV · 发表于 Post on 3 day ago

请问楼主精修好了吗，是按照分子式自己画吗

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