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[综合交流] 使用sobEDA做能量分解分析报错

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楼主
老师您好,Gaussian16使用的是A03版本,Multiwfn_3.8_dev_bin_Linux_noGUI用的是2024年10月24日版本,算的体系比较大,算第一个体系计算成功了,算第二个大小差不多的体系时输出下面的内容Note: Calculation of whole system will be conducted in unrestricted way

Generating fch file of promolecular state via Multiwfn (promol.fch)
Running: unfchk promol.fch promol.chk
Error: segmentation violation
   rax 0000000000000000, rbx 000000000231fdd8, rcx ffffffffffffffff
   rdx 0000000000002352, rsp 00007ffe1d13e938, rbp 00007ffe1d13e990
   rsi 000000000000000b, rdi 0000000000002352, r8  00002af3c8db1ac0
   r9  00002af3c8db1ac0, r10 00007ffe1d13dd20, r11 0000000000000202
   r12 00007ffe1d13ec20, r13 000000000231ffc1, r14 0000000000000003
   r15 00007ffe1d140168
  /lib64/libpthread.so.0(+0xf5d0) [0x2af3c8fa15d0]
  /lib64/libc.so.6(kill+0x7) [0x2af3c94e64d7]
  unfchk() [0x485819]
  unfchk() [0x46aad0]
  unfchk() [0x479d12]
  unfchk() [0x47b626]
  unfchk() [0x4504d1]
  unfchk() [0x44f4aa]
  unfchk() [0x44f3f4]
  /lib64/libc.so.6(__libc_start_main+0xf5) [0x2af3c94d23d5]
  unfchk() [0x44f2e9]
./sobEDA.sh: line 159:  9042 Aborted                 (core dumped) unfchk promol.fch promol.chk > /dev/null
Generating Gaussian input file of promolecular state via Multiwfn (promol.gjf)
Running: g16 < promol.gjf &> promol.out
Error encountered, please check corresponding output file! Now script exits
修改export GAUSS_MEMDEF为20GB也不管用
附件为输入文件,谢谢您。

fragment.txt

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sobEDA.sh

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system.xyz

12.9 KB, 下载次数 Times of downloads: 2

template.gjf

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发表于 Post on 2024-11-9 09:12:16 | 只看该作者 Only view this author
检查promol.fch产生成功了没有。例如Multiwfn载入后用主功能0看轨道。文件正常的话,手动用unfchk转一次看看情况
并且尝试Au团簇的片段当单重态闭壳层看是否能成功
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
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Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大的量子化学波函数分析程序)
ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu
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