计算金属盐对有机物的作用机理，该怎么建模呢

落微

请问我想计算金属盐对有机物的作用机理，该怎么建模呢，金属盐，比如Na2CO3是金属离子和酸根离子分开建模吗，感谢各位前辈解惑

wzkchem5

首先要确定这个盐是以固体形式参与反应的，还是以溶解态参与反应的。注意光从肉眼观察固体有没有溶解是不够的，有的盐在有机溶剂里是微溶的，靠溶解的那一小部分进行的反应。
其次，如果这个盐先溶解再反应，要确定这个盐在这个溶剂里是强电解质还是弱电解质。一般对于常见盐和常见溶剂，都可以查到文献结论

sobereva

问题太含糊。先交代清楚想以什么程序以什么方法进行计算，以及作用的条件是什么

如果当做周期性的表面来做DFT计算研究（如使用CP2K程序），这是第一性原理计算范畴，应当发到第一性原理版块。此时通过实验的Na2CO3晶体结构通过扩胞、切晶面来得到晶体表面。
如果是液相的作用那又是另一码事

落微

sobereva 发表于 2024-11-15 12:43
问题太含糊。先交代清楚想以什么程序以什么方法进行计算，以及作用的条件是什么

如果当做周期性的表面来 ...

感谢社长提醒，我是在高温环境下用Gaussian进行计算，应该是气态环境，之前计算了一些金属离子对芳香环生长的影响，现在想看一下金属盐（如碳酸钠整体）及碳酸根、硫酸根这些酸根离子对芳环的影响

落微

wzkchem5 发表于 2024-11-14 22:13
首先要确定这个盐是以固体形式参与反应的，还是以溶解态参与反应的。注意光从肉眼观察固体有没有溶解是不够 ...

感谢老师回复，我这个应该不算溶剂，是在高温环境里，有机物和金属盐都气化了，比如碳酸Na热解生成Na、CO2等，有机物开环或者生长氧化，请问老师这种该怎么建模呢

wzkchem5

落微 发表于 2024-11-15 13:39
感谢老师回复，我这个应该不算溶剂，是在高温环境里，有机物和金属盐都气化了，比如碳酸Na热解生成Na、CO ...

盐能气化的温度下，有机物早就碳化或者燃烧了吧。。。假如研究的就是碳化或者燃烧的过程，建议用ReaxFF跑MD

落微

wzkchem5 发表于 2024-11-15 22:29
盐能气化的温度下，有机物早就碳化或者燃烧了吧。。。假如研究的就是碳化或者燃烧的过程，建议用ReaxFF跑 ...

对的老师，也在跑MD，但想看对金属盐单个模化物的影响，不知道咋建模

wzkchem5

落微 发表于 2024-11-16 15:09
对的老师，也在跑MD，但想看对金属盐单个模化物的影响，不知道咋建模

首先正如你所说，Na2CO3如果气化了，估计就不是Na2CO3了，虽然分解成Na不至于，但是分解成Na2O和CO2还是很有可能的。所以应当先确定金属盐在你目标温度下的主要存在形式，这个虽然也可以用计算方式预测，但是如果盐是很常见的盐的话，还是查实验数据比较好

落微

wzkchem5 发表于 2024-11-16 22:38
首先正如你所说，Na2CO3如果气化了，估计就不是Na2CO3了，虽然分解成Na不至于，但是分解成Na2O和CO2还是 ...

好的好的，明白了，感谢老师，另外还想再问一下，计算方式预测的话，是用分子动力学计算看一下盐热解的最终产物吗

wzkchem5

落微 发表于 2024-11-17 13:37
好的好的，明白了，感谢老师，另外还想再问一下，计算方式预测的话，是用分子动力学计算看一下盐热解的最 ...

假如已知热解极其快（ps量级），那么可以。否则需要用过渡态理论

落微

wzkchem5 发表于 2024-11-17 22:42
假如已知热解极其快（ps量级），那么可以。否则需要用过渡态理论

好的，谢谢老师，过渡态理论是和有机体系用高斯算一样吗，初猜结构然后用高斯算过渡态，如果是这样的话，初猜结构的离子键咋建模呢

wzkchem5

落微 发表于 2024-11-18 07:36
好的，谢谢老师，过渡态理论是和有机体系用高斯算一样吗，初猜结构然后用高斯算过渡态，如果是这样的话， ...

对。初猜结构通过构型搜索确定，例如用ABCluster、Molclus或者ORCA的GOAT模块

落微

wzkchem5 发表于 2024-11-18 17:27
对。初猜结构通过构型搜索确定，例如用ABCluster、Molclus或者ORCA的GOAT模块

好的，我试一下，谢谢您