进行非平衡动力学模拟驱油时，油滴经常跑出洞

chemTT · 发表于 Post on 2025-4-12 17:26:14

本帖最后由 chemTT 于 2025-4-12 17:26 编辑

首先进行了平衡动力学模拟，在二氧化硅板上吸附了油滴，然后再将表面活性剂吸附到油滴当中。然后在盒子左侧加一方解石推板推动水流动进行驱油模拟，但是在模拟开始后油滴经常跑出洞，请问这可能是什么原因造成的？

chema · 发表于 Post on 2025-4-12 21:17:00

gmx solvate添加的水分子不是致密的，你跑的是NVT吧，可以跑个短时间的NPT使水分子致密一点

mol · 发表于 Post on 2025-4-13 11:21:55

确实是挺有意思的现象

chemTT · 发表于 Post on 2025-4-14 08:49:02

chema 发表于 2025-4-12 21:17
gmx solvate添加的水分子不是致密的，你跑的是NVT吧，可以跑个短时间的NPT使水分子致密一点

确实是因为gmx solvate加的水不致密，我又手动插入了一些水分子就不会有洞了

chema · 发表于 Post on 2025-4-14 13:52:46

chemTT 发表于 2025-4-14 08:49
确实是因为gmx solvate加的水不致密，我又手动插入了一些水分子就不会有洞了

我比较好奇你为啥加在左侧添加方解石，一般不都是石墨烯吗

chema · 发表于 Post on 2025-4-14 14:41:33

mol 发表于 2025-4-13 11:21
确实是挺有意思的现象

嘿嘿嘿师兄

其实感觉还是水分子收缩，把油滴扯出个洞来了

chemTT · 发表于 Post on 2025-4-14 19:28:22

chema 发表于 2025-4-14 13:52
我比较好奇你为啥加在左侧添加方解石，一般不都是石墨烯吗

差不多吧，不都是起到一个推板的作用吗

mol · 发表于 Post on 2025-4-15 10:22:21

chema 发表于 2025-4-14 14:41
嘿嘿嘿师兄
其实感觉还是水分子收缩，把油滴扯出个洞来了

学习了，我理解的是gmx solvate的水应该是跑平衡后的水，是致密的，但是加入到体系中后，固体界面对水有极化作用，导致界面附近水密度增大大，这样就把油滴给拉出个洞了

chema · 发表于 Post on 2025-4-15 14:31:49

mol 发表于 2025-4-15 10:22
学习了，我理解的是gmx solvate的水应该是跑平衡后的水，是致密的，但是加入到体系中后，固体界面对水有 ...

还是师兄更高屋建瓴一点，我觉得师兄说的也挺有道理的

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