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[CP2K] 计算COHP时,提示:0 orbitals will be calculated

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本帖最后由 kaikai 于 2025-5-26 10:05 编辑

各位老师好,我使用CP2K计算Pt(111)表面吸附H2,H2在表面解离后,我想计算形成的Pt-H的COHP,以下是我的计算步骤:
1.计算文件进行计算,计算文件附件上传
2.使用Multiwfn计算COHP。选择10选项,再选择 -7(Change to COHP plotting mode)
3. 在计算文件中已经生成 .csr文件,因此选择输入2 Loading Fock/KS matrix from a file
4.导入生成的.csr文件进行计算
5. 后续的步骤就是常规的命名组分
最后计算的时候就出现了以下的问题:

请问:是我计算COHP计算步骤出现问题还是我的计算文件出现问题?我现在的目的就是想知道Pt-H的COHP以及ICOHP数值,请问应当如何操作?

202505261001465723..png (32.42 KB, 下载次数 Times of downloads: 17)

计算结果显示

计算结果显示

202505261001062621..png (16.2 KB, 下载次数 Times of downloads: 15)

组分命名阶段

组分命名阶段

Pt_111-H2-2-top.inp

12.28 KB, 下载次数 Times of downloads: 6

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发表于 Post on 2025-5-27 05:40:20 | 只看该作者 Only view this author
Multiwfn一开始要载入CP2K的molden文件,而非inp文件
如果载入的就是molden文件,先确保能正常绘制PDOS,再说COHP的事
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
欢迎加入北京科音微信公众号获取北京科音培训的最新消息,并避免错过网上有价值的计算化学文章!
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思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大、极为流行的量子化学波函数分析程序)
Google Scholar:https://scholar.google.com/citations?user=tiKE0qkAAAAJ
ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2025-5-27 08:47:52 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2025-5-27 05:40
Multiwfn一开始要载入CP2K的molden文件,而非inp文件
如果载入的就是molden文件,先确保能正常绘制PDOS, ...

谢谢老师,我尝试一下

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发表于 Post on 2025-6-11 15:34:13 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2025-5-27 05:40
Multiwfn一开始要载入CP2K的molden文件,而非inp文件
如果载入的就是molden文件,先确保能正常绘制PDOS, ...

社长好,我的情况也是楼主一样,我载入molden文件可以正常绘制PDOS,但不能绘制COHP,显示的是0 orbitals will be calculated。然后我尝试了一下,发现不开启smearing的时候产生的molden文件可以正常绘制COHP,但不开启smearing发现SCF难以收敛,请问这个情况怎么解决呢?

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发表于 Post on 2025-6-11 18:05:36 | 只看该作者 Only view this author
车仔55 发表于 2025-6-11 15:34
社长好,我的情况也是楼主一样,我载入molden文件可以正常绘制PDOS,但不能绘制COHP,显示的是0 orbitals ...

绘制的能量范围没选对,不包含任何能级,自然绘制不出来
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
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发表于 Post on 2025-6-16 21:15:04 | 只看该作者 Only view this author
本帖最后由 fhua 于 2025-6-16 21:16 编辑

能分享一下绘制COHP的详细步骤?我目前会用CP2K计算后,根据CP2K培训讲义中的例子用Multiwfn载入CP2K的molden文件绘制DOS,PDOS,但不会COHP的绘制方法。

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发表于 Post on 2025-6-17 06:18:32 | 只看该作者 Only view this author
fhua 发表于 2025-6-16 21:15
能分享一下绘制COHP的详细步骤?我目前会用CP2K计算后,根据CP2K培训讲义中的例子用Multiwfn载入CP2K的mold ...

第4届北京科音CP2K第一性原理计算培训班(http://www.keinsci.com/KFP)的“能带结构和态密度的计算” 部分专门讲了怎么对周期性体系绘制COHP,给了详细说明和完整的例子。

Multiwfn手册4.10.7节里也有COHP的例子,只不过演示的是分子体系。
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
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发表于 Post on 2025-6-17 10:06:37 | 只看该作者 Only view this author
本帖最后由 fhua 于 2025-6-17 10:40 编辑
sobereva 发表于 2025-6-17 06:18
第4届北京科音CP2K第一性原理计算培训班(http://www.keinsci.com/KFP)的“能带结构和态密度的计算” 部 ...
谢谢老师,可惜我参加的是第三界(准确来说是购买的第三界培训班的资料,没能去参加),要是等一等参加第4届就好了。去年购买资料学习到现在很多还没懂,还在继续努力学习中。

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发表于 Post on 2025-6-18 08:28:04 | 只看该作者 Only view this author
楼主,我正在学习CP2K,想拿一些Pt、Pd等金属体系作为练习,看看我算的靠不靠谱,但是发现网上下载的一些文献都是VASP做的计算,你能分享一些你下载的关于CP2K计算的文献吗?

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2025-6-18 08:51:49 | 只看该作者 Only view this author
fhua 发表于 2025-6-18 08:28
楼主,我正在学习CP2K,想拿一些Pt、Pd等金属体系作为练习,看看我算的靠不靠谱,但是发现网上下载的一些文 ...

我是查看cp2k官网上有使用该软件发表的文章集合,这是连接:https://www.cp2k.org/science。或是谷歌学术中使用cp2k作为关键词进行搜索,也能找到很多

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发表于 Post on 2025-6-18 09:04:30 | 只看该作者 Only view this author
kaikai 发表于 2025-6-18 08:51
我是查看cp2k官网上有使用该软件发表的文章集合,这是连接:https://www.cp2k.org/science。或是谷歌学术 ...

多谢多谢,可惜google都打不开啊

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发表于 Post on 2025-6-19 05:45:17 | 只看该作者 Only view this author
fhua 发表于 2025-6-18 09:04
多谢多谢,可惜google都打不开啊

抱怨这个只会被同行笑话
了解怎么使用真正的国际互联网、访问google,这是做计算的人必须具有的能力。这个都解决不了根本没法做计算。
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发表于 Post on 2025-6-19 09:52:33 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2025-6-19 05:45
抱怨这个只会被同行笑话
了解怎么使用真正的国际互联网、访问google,这是做计算的人必须具有的能力。这 ...

呵呵,见笑了。其实我们组一直做实验数据发表文章,但是现在文章里不搞点计算还不行,请人代算收费又贵,只好自己试着学一学,所以就购买了cp2k第三届培训班的资料自学,但是以前从没涉及计算,感觉好难,培训班的资料反复看,再加上大家的热心答疑,才终于明白了一些。本人对计算机、网络啥的平时都是最简单的使用即可,看来只能尽力多学了,但没人指点学习起来难度很大。

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2025-6-20 09:22:26 | 只看该作者 Only view this author
fhua 发表于 2025-6-19 09:52
呵呵,见笑了。其实我们组一直做实验数据发表文章,但是现在文章里不搞点计算还不行,请人代算收费又贵, ...

cp2k官网打不开的话也没有关系,现在国内应该还是有不i少的谷歌学术镜像网站的,也可以使用,至少比没的用强

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发表于 Post on 2025-6-21 13:46:49 | 只看该作者 Only view this author
kaikai 发表于 2025-6-20 09:22
cp2k官网打不开的话也没有关系,现在国内应该还是有不i少的谷歌学术镜像网站的,也可以使用,至少比没的 ...

多谢指点

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