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[综合交流] 求指导显式溶剂化自由能计算方法

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各位老师好,我目前得到了一个机器学习势能模型,想计算Li离子在各种溶剂(以EC为例)中的溶剂化自由能,卢老师在这篇帖子(谈谈隐式溶剂模型下溶解自由能和体系自由能的计算 - 量子化学 (Quantum Chemistry) - 计算化学公社)中的解释我仍不完全理解,希望得到进一步指导:

1. 我想计算Li离子在EC中的溶剂化自由能的话,是不是先确认Li和EC的配位构型(通过MD得到径向分布函数),然后根据这个配位结构搭建团簇结构做构型搜索,找到最稳定的构型,最后根据Li离子在气相的自由能,EC在EC环境下的自由能,与EC+Li在EC环境下的自由能作差得到?请问这个自由能只能通过Gaussian等软件的Gibbs Free Energy值得到吗?我的模型只能计算势能是不是就用不上?另外,需要考虑第二溶剂化层吗?


2.我还想绘制自由能-(Li-O)距离曲线,由于机器学习势模型固定,不能额外添加势约束,可不可以固定一系列的Li-O距离,然后做限制性分子动力学模拟,最后积分得到自由能变?

问题较多,感谢老师们解惑


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