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[综合交流] 求助:请问分子动力学模拟如何比较不同小分子的刚性柔性

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楼主
我想比较不同小分子的刚性柔性,请问用gromacs来模拟的话有什么指标能反映不同小分子的柔性呢?我需要对不同的小分子柔性进行比较

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发表于 Post on 2025-12-16 15:45:48 | 只看该作者 Only view this author
不模拟的直接数有多少个rotatable bonds其实就可以了
敬仰一针见血的指责,厌倦别有用心的赞美。

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发表于 Post on 2025-12-17 04:11:09 | 只看该作者 Only view this author
跑动力学之后计算RMSF可以衡量
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