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[GROMACS] gromacs模拟锂离子电池电解液,混合溶剂体系压力波动很大

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我的文件如下所示,但是在进行NPT系综进行模拟的时候,压力项波动很大,想请教一下原因是什么?我的itp文件时用Sobtop生成的。

202601092049273512..png (61.75 KB, 下载次数 Times of downloads: 4)

prod.log

prod.log

prod.mdp

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TFS.itp

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DME.itp

9.81 KB, 下载次数 Times of downloads: 0

DOL.itp

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NO3.itp

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发表于 Post on 2026-1-9 21:30:04 | 只看该作者 Only view this author
以下帖子搜压力:

谈谈怎么判断分子动力学模拟是否达到了平衡
http://bbs.keinsci.com/forum.php ... 2&fromuid=64740
(出处: 计算化学公社)
敬仰一针见血的指责,厌倦别有用心的赞美。

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3#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2026-1-10 10:37:02 | 只看该作者 Only view this author
student0618 发表于 2026-1-9 21:30
以下帖子搜压力:

谈谈怎么判断分子动力学模拟是否达到了平衡

我看过这个,但是我通过gmx energy -f eq.edr 选项里面并没有密度选项。另外我在进行NPT模拟的时候我的倒计时一直不怎么波动。

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发表于 Post on 前天 15:30 | 只看该作者 Only view this author
小天才 发表于 2026-1-10 10:37
我看过这个,但是我通过gmx energy -f eq.edr 选项里面并没有密度选项。另外我在进行NPT模拟的时候我的倒 ...

这个回复,结合你的压力涨落大,怀疑你实际运行的mdp文件和你提交的mdp不是一个文件,你可能实际跑的时候用了NVT。

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