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[Gaussian/gview] gview上显示的原子为什么有两个序号

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各位老师好!本人最近在CCDC上下载了一个晶体结构想做一下理论计算的学习,但是这个分子在gview上显示一个原子都是两个序号,做结构优化的时候也会报错,请问这是为什么,应该如何解决呢,谢谢大家!

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发表于 Post on 2026-1-9 23:14:28 | 只看该作者 Only view this author
重叠了
某不知名实验组从苞米地里长出来的计算选手

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2026-1-9 23:19:54 | 只看该作者 Only view this author

请问这个可以改吗,还是这个结构自己的问题

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发表于 Post on 2026-1-10 01:47:23 | 只看该作者 Only view this author
结构问题
两个原子坐标相同,自然序号重叠在一起。自行删掉多余的
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2026-1-10 13:26:54 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2026-1-10 01:47
结构问题
两个原子坐标相同,自然序号重叠在一起。自行删掉多余的

好的,谢谢老师!

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发表于 Post on 2026-1-11 09:47:45 | 只看该作者 Only view this author
除了重叠了,也可能是之前删除原子的时候留下一个问号(?)。先不着急删除,先保存成.gjf文件,然后打开看看文本里面有没有?。如果没有?,然后再从GV软件里面删除重叠

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