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[CP2K] 用CP2K计算NEB,每个NEB点都停留在Step1,且NEB.out不更新

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本帖最后由 Ying_Zhang 于 2026-2-24 01:59 编辑

麻烦各位老师提供一下建议。

计算89个原子的体系,在NEB.inp中,设置NUMBER_OF_REPLICA 9和NPROC_REP 48,提交任务时使用9个节点(每个节点48核)。不知道为啥,在NEB.out中,在一开始的“ REPLICA| MPI process to grid(group,rank) correspondence:”就停止更新信息(图1)。且在各个NEB点的NEB-BAND.out文件中,始终停留在Step1,Band  Step  Nr. :    1,一直显示在这个阶段计算(图2)。下面是NEB输入和输出文件,以及各个点的输出文件及提交文件的脚本。CI-NEB文件中,有结构文件,如果有时间,麻烦大家帮忙运行一下,不知道是不是CP2K编译的问题。

谢谢老师们!


Screenshot 2026-02-23 181338.png (114.35 KB, 下载次数 Times of downloads: 2)

NEB.out

NEB.out

Screenshot 2026-02-23 181402.png (109.78 KB, 下载次数 Times of downloads: 2)

NEB-BAND.out

NEB-BAND.out

NEB.inp

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NEB.out

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NEB-BAND1.out

148.04 KB, 下载次数 Times of downloads: 2

NEB-BAND2.out

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NEB-BAND3.out

148.04 KB, 下载次数 Times of downloads: 0

NEB-BAND4.out

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NEB-BAND5.out

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NEB-BAND6.out

145.04 KB, 下载次数 Times of downloads: 0

NEB-BAND7.out

148.04 KB, 下载次数 Times of downloads: 4

NEB-BAND8.out

148.04 KB, 下载次数 Times of downloads: 1

NEB-BAND9.out

148.04 KB, 下载次数 Times of downloads: 2

runscript.strand

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任务脚本

CI-NEB.zip

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发表于 Post on 14 hour ago | 只看该作者 Only view this author
确保单节点跑没问题再说多节点的事,避免把问题复杂化
从副本的out文件来看正在跑着,并非异常卡住
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ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu

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发表于 Post on 10 hour ago | 只看该作者 Only view this author
正常的,主函数需要尝试不同NEB步长,会要求各副本进行多次SCF计算以提供主函数所需的力、能量等数据,直到主函数找到能量下降的点才会更新新的一步out点位。

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 楼主 Author| 发表于 Post on halfhour ago | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2026-2-25 04:11
确保单节点跑没问题再说多节点的事,避免把问题复杂化
从副本的out文件来看正在跑着,并非异常卡住

sob老师,我的一个节点48核,现在每个结构89个原子,有10个NEB点,48个核够用吗?顺便想问一下,您一般如何选择节点数,基于您体系的原子数量,以及NEB/结构优化/能量计算任务,感谢sob老师回复。

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