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[综合交流] 求助研究短肽与生物膜的相互作用的两个方案的选择

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求助❗我想研究肽与生物膜的相互作用,有两个方案不知道选哪个好(短肽)
1.先分别做单肽和膜的平衡,然后将几个肽放到膜表面最后做MD模拟
2.先在盒子里放几个肽,让短肽自组装,平衡后在放到膜表面做MD模拟

最后在做一个伞形采样,让肽穿模做分析

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发表于 Post on yesterday 22:33 | 只看该作者 Only view this author
目的是什么? 不同方案对应不同目的。考察相互作用是位了证明什么?
敬仰一针见血的指责,厌倦别有用心的赞美。

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3#
发表于 Post on 19 hour ago | 只看该作者 Only view this author
仔细看置顶帖:
发帖时务必注意恰当填写标题!!!
http://bbs.keinsci.com/forum.php ... 8&fromuid=89463
(出处: 计算化学公社)

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发表于 Post on 13 hour ago | 只看该作者 Only view this author
仔细看http://bbs.keinsci.com/thread-9348-1-1.html,标题必须准确清楚,不可乱用叹号。我已把你的不恰当标题 “求助❗我想研究肽与生物膜的相互作用” 改了,以后务必注意
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
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发表于 Post on 13 hour ago | 只看该作者 Only view this author
先明确、详细说清楚你要研究的实际问题是什么,然后才是谈怎么做的事
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 楼主 Author| 发表于 Post on 9 hour ago | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2026-4-21 07:35
仔细看http://bbs.keinsci.com/thread-9348-1-1.html,标题必须准确清楚,不可乱用叹号。我已把你的不恰当 ...

好的老师

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 楼主 Author| 发表于 Post on 9 hour ago | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2026-4-21 07:37
先明确、详细说清楚你要研究的实际问题是什么,然后才是谈怎么做的事

老师,我研究抗菌肽对微生物膜的损伤

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 楼主 Author| 发表于 Post on 9 hour ago | 只看该作者 Only view this author
student0618 发表于 2026-4-20 22:33
目的是什么? 不同方案对应不同目的。考察相互作用是位了证明什么?

是想研究抗菌肽对微生物膜的损伤

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发表于 Post on 5 hour ago | 只看该作者 Only view this author
如果这个过程不涉及协同效应,放一个肽在盒子里就完了,否则需要考虑放多个肽
如果你要研究从肽的附着到与膜相互作用的全过程,肽一开始应当放在溶液区域
肽之间未必会自组装,若没有实验信息,MD跑了才知道情况
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 楼主 Author| 发表于 Post on 3 hour ago | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2026-4-21 15:09
如果这个过程不涉及协同效应,放一个肽在盒子里就完了,否则需要考虑放多个肽
如果你要研究从肽的附着到与 ...

谢谢老师

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