计算化学公社

 找回密码 Forget password
 注册 Register
Views: 131|回复 Reply: 2
打印 Print 上一主题 Last thread 下一主题 Next thread

[Lammps] 构建高岭石晶体没有键角信息

[复制链接 Copy URL]

33

帖子

0

威望

169

eV
积分
202

Level 3 能力者

大家好,我想使用Materials Studio构建高岭石晶体,通过msi2lmp导出data文件到Lammps中使用。
在Materials Studio中按照clayff.frc软件中的力场类型和电荷设置了Al、Si、O和H原子,导出car文件后,bond、angle、dihedral和improper均没有信息,同时也有下面这种警告字样,请问这是什么问题呢:
WARNING inconsistent # of connects on atom 6506 type ob
WARNING inconsistent # of connects on atom 6509 type ob
WARNING inconsistent # of connects on atom 6510 type ob


43

帖子

0

威望

521

eV
积分
564

Level 4 (黑子)

2#
发表于 Post on 2026-7-19 12:41:46 | 只看该作者 Only view this author
很多软件包括MS,都无法获得非常全面的键角信息,尤其是现在材料这么多的情况下。
但是我看你输出的这个in文件,格式是对的,只是缺少信息,那么你就可以在网上查找文献,将对应的信息补充修改掉。

76

帖子

0

威望

2255

eV
积分
2331

Level 5 (御坂)

3#
发表于 Post on 6 day ago | 只看该作者 Only view this author
1.少用msi2lmp,这个经常出问题
2.clayff本来除了羟基外,都没有键信息。这个你看力场的最初论文就知道了。clayff非常特殊,它是用非键作用描述硅酸盐内部的信息的。如果你的拓扑关系、原子类型和电荷没有错误,clayff可以不需要键参数就可以很好描述硅酸盐的特性(反之,结构直接散架)

本版积分规则 Credits rule

手机版 Mobile version|北京科音自然科学研究中心 Beijing Kein Research Center for Natural Sciences|京公网安备 11010502035419号|计算化学公社 — 北京科音旗下高水平计算化学交流论坛 ( 京ICP备14038949号-1 )|网站地图

GMT+8, 2026-7-27 01:00 , Processed in 0.224612 second(s), 23 queries , Gzip On.

快速回复 返回顶部 返回列表 Return to list