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[建模与可视化] 实现完整输入输出的ORCA可视化软件orca-view v2

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本帖最后由 Kevin_Chen 于 2026-7-12 21:43 编辑

在五天之前我在论坛上发表了能直接可视化ORCA输出文件的可视化工具orca-view - 量子化学 (Quantum Chemistry) - 计算化学公社,之后我又结合自己使用Gaussview时的一些想法在此基础上开发了orca-view v2,增加了分子构建方面的功能,主要功能如下:
1.在orca-view的基础上增加了输入文件的创建功能,可以基于目前的结构编写输入文件,并根据ORCA的功能块设置进行了优化

2.用GFN-FF/GFN-xTB0/1/2替代Gaussview基于分子力场的Clean功能,并可以只优化选中原子

3.选中原子后,点击View按钮切换到Transform模式可以通过左中右键变换选中部分

4.调整键长/键角/二面角时允许自定义原子组,在设定了变换参考后,可以将想要一起移动的原子放到对应原子组(A/B两个)中,并选择移动方式(可以Shift+鼠标拉框批量选择),之后使用鼠标滚轮调整

源码和预编译exe文件:https://share.weiyun.com/UqjojUrJ

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发表于 Post on 2026-7-12 22:20:19 | 只看该作者 Only view this author
感谢大神分享

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发表于 Post on 2026-7-13 09:34:15 | 只看该作者 Only view this author
大佬有linux版本的吗

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2026-7-13 09:51:59 | 只看该作者 Only view this author
李唯一 发表于 2026-7-13 09:34
大佬有linux版本的吗

目前没有编译Linux版,我有空去编译一下

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发表于 Post on 2026-7-14 14:02:47 | 只看该作者 Only view this author
亲测非常实用的小工具,感谢作者分享
反馈一个小问题,在打开OPT任务的输出文件时,前后会各多一帧能量为0的结构,导致优化的能量变化图不太方便看

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Level 5 (御坂)

计算化学路人甲

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发表于 Post on 2026-7-14 14:46:52 | 只看该作者 Only view this author
本帖最后由 Novice 于 2026-7-14 18:24 编辑

看到有人在ORCA论坛里推这个Autochemy:
https://github.com/NitishAuto/Autochemy
Lite Web Version: https://autochemy.xyz/

好像和楼主想法一样

----
我没有用,也没有对比哪个更好。放在这里是想两者有没有可能合作,不要重复造轮子(怪费劲的)。

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发表于 Post on 2026-7-14 15:32:59 | 只看该作者 Only view this author
Novice 发表于 2026-7-14 14:46
看到有人在ORCA论坛里推这个Autochemy:
https://github.com/NitishAuto/Autochemy
Lite Web Version: htt ...

这个牛

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发表于 Post on 2026-7-14 19:17:18 | 只看该作者 Only view this author
您这个软件如何实现环状分子的构建?(尤其是杂环)

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9#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2026-7-15 13:21:20 | 只看该作者 Only view this author
邱诺狼 发表于 2026-7-14 19:17
您这个软件如何实现环状分子的构建?(尤其是杂环)

杂环的话我一般是这样构建(以吡咯为例):先构建顺丁二烯,然后把两个氢选中后删掉,再放一个氮原子和氢原子,跑一下极小化就可以了

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发表于 Post on 2026-7-15 21:38:11 | 只看该作者 Only view this author
Kevin_Chen 发表于 2026-7-15 13:21
杂环的话我一般是这样构建(以吡咯为例):先构建顺丁二烯,然后把两个氢选中后删掉,再放一个氮原子和氢 ...

谢谢

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2026-7-16 14:01:58 | 只看该作者 Only view this author
fwz3888 发表于 2026-7-14 14:02
亲测非常实用的小工具,感谢作者分享
反馈一个小问题,在打开OPT任务的输出文件时,前后会各多一帧能量为0 ...

方便把出现问题的文件附上嘛?我之前也遇到过这个问题,已经修复过了,但可能遇到了一些新的问题

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发表于 Post on yesterday 21:42 | 只看该作者 Only view this author
如果可能,编译一个Android平台的版本

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 楼主 Author| 发表于 Post on yesterday 22:49 | 只看该作者 Only view this author
元无虚空 发表于 2026-7-25 21:42
如果可能,编译一个Android平台的版本

用Android做建模嘛?感觉有点不太方便,我在编译Linux版本的时候遇到了一些问题,可能暂时不会考虑编译Android版本,如果有需要可以试着从源码编译

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