计算化学公社

 找回密码 Forget password
 注册 Register
Views: 91|回复 Reply: 1
打印 Print 上一主题 Last thread 下一主题 Next thread

[NBO相关] 求助NBO7联合G16的使用问题

[复制链接 Copy URL]

5

帖子

0

威望

77

eV
积分
82

Level 2 能力者

本帖最后由 adver90 于 2026-7-24 11:51 编辑

各位老师好,我参考Which NICS Aromaticity Index for Planar π Rings Is Best? | Organic Letters和NBO手册及Sob老师的相关博文撰写输入文件,当我用gaussian16能调用NBO6对研究的体系做NCS时它报错如下:
Leave Link  601 at Thu Jul 23 02:54:39 2026, MaxMem=  1073741824 cpu:             216.2 elap:             103.9
(Enter /share/apps/gaussian/g16/l612.exe)
Running external command "gaunbo6 R"
         input file       "/tmp/Gau-1410.EIn"
         output file      "/tmp/Gau-1410.EOu"
         message file     "/tmp/Gau-1410.EMs"
         fchk file        "/tmp/Gau-1410.EFC"
         mat. el file     "/tmp/Gau-1410.EUF"


Writing WrtUnf unformatted file "/tmp/Gau-1410.EUF"
...(此处省略部分内容)
REAL PARAMETERS                     NI= 1 NR= 1 NTot=       2 LenBuf=    2 NRI=1 N=      40
External program failed.
Error termination via Lnk1e in /share/apps/gaussian/g16/l612.exe at Thu Jul 23 02:56:22 2026.
研究的体系的输入文件如下:
%nprocshared=24
%mem=8GB
%chk=CMO.chk
#p b3lyp/genecp NMR=GIAO pop=nbo6read nosymm  

CMO

-1 1

[坐标]

-C H P O 0
6-311G(2d,p)
****
-Re Br 0
def2TZVP
****

-Re Br 0
def2TZVP

$NBO NCS=MO,XYZ,0.01 $END


之后我尝试将原本在/home中的gennbo复制到自己的文件夹中并调整对应的路径,但是输出文件中仍然报错如上,并且显示 sh: gaunbo6: command not found,之后我查阅已发的帖子和博文等尝试对小体积体系苯环进行NCS计算(输入文件见附件),其报错如下:
Calculating spin-rotation constants. Leave Link  601 at Fri Jul 24 04:59:17 2026, MaxMem=  1073741824 cpu:              52.3 elap:              10.8
(Enter /share/apps/gaussian/g16/l607.exe)
Error: Unrecognizable keyword  >>NCS   <<
Program must halt.
Error
Error termination via Lnk1e in /share/apps/gaussian/g16/l607.exe at Fri Jul 24 04:59:18 2026.
注:之前也尝试过使用csgt计算,但是发现计算出来的NICS值和giao计算出来的有一定差异,故选择使用NBO
请问该如何解决?谢谢各位老师









BENCMO.gjf

879 Bytes, 下载次数 Times of downloads: 3

苯的输入文件

6万

帖子

99

威望

6万

eV
积分
128574

管理员

公社社长

2#
发表于 Post on yesterday 11:01 | 只看该作者 Only view this author
计算出来的NICS值和giao计算出来的有一定差异,故选择使用NBO

这不是用NBO的理由。本来CSGT和GIAO必然会有差异,横向对比的时候用的磁屏蔽张量的计算方法一致就完了

sh: gaunbo6: command not found纯粹是NBO的运行环境配置问题

你的帖子里写的nbo6read,结果输入文件却是pop=nboread,完全不符!后者调用的NBO 3.1根本不支持这种NCS写法

def2系列基组对Br是全电子基组,没法定义赝势

北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
欢迎加入北京科音微信公众号获取北京科音培训的最新消息,并避免错过网上有价值的计算化学文章!
欢迎加入人气极高、专业性特别强的理论与计算化学综合交流群思想家公社QQ群(群号见此链接),合计达一万多人。北京科音培训班的学员在群中可申请VIP头衔,提问将得到群主Sobereva的最优先解答。
思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大、极为流行的量子化学波函数分析程序)
Google Scholar:https://scholar.google.com/citations?user=tiKE0qkAAAAJ
ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu

本版积分规则 Credits rule

手机版 Mobile version|北京科音自然科学研究中心 Beijing Kein Research Center for Natural Sciences|京公网安备 11010502035419号|计算化学公社 — 北京科音旗下高水平计算化学交流论坛 ( 京ICP备14038949号-1 )|网站地图

GMT+8, 2026-7-26 18:55 , Processed in 0.225381 second(s), 23 queries , Gzip On.

快速回复 返回顶部 返回列表 Return to list