单分子和聚合物的偶极矩计算

万卷书万里路 · 发表于 Post on 2017-7-16 21:59:56

大家好！
我想计算几个结构的偶极矩，读到一篇文章用计算的偶极矩解释了器件界面性能的差异，（附上参考文献）

我首先用文章中提到的方法重复了文章中的A分子，然后得到了与文章表格中一致的结果，然后计算我需要计算的分子，但是有一个是聚合物，是聚合度为1700的聚乙烯醇，这个聚合物我应该怎么计算它的偶极矩呢？
聚合物的偶极矩，还跟单分子的偶极矩是一个意义上的偶极矩吗？
这个1700聚合度的聚乙烯醇这么长的链，一般是蜷曲的吧，有不同的构象，构象不一样偶极矩也不一样吧
想问，
1.怎么计算这个聚乙烯醇的偶极矩？
2.用计算的分子偶极矩来解释界面接触，合理吗？
谢谢！

sobereva · 发表于 Post on 2017-7-17 17:42:21

对这么大体系，偶极矩这个概念已经丧失意义了，而且直接受构象影响。至于偶极矩这个概念对于你的那个研究会产生什么影响我不清楚，但很大体系，讨论偶极矩应当也得是讨论某个片段的局部偶极矩。

如果真要计算这么巨大体系的偶极矩，一般建议基于MMFF94原子电荷来计算，量化肯定算不动（除非MOPAC里开MOZYME用半经验来算，但还不如MMFF94的偶极矩的结果好）

万卷书万里路 · 发表于 Post on 2017-7-17 19:13:17

sobereva 发表于 2017-7-17 17:42
对这么大体系，偶极矩这个概念已经丧失意义了，而且直接受构象影响。至于偶极矩这个概念对于你的那个研究会 ...

嗯嗯，谢谢Sob老师！
我一开始取了聚合度为20的一个片段计算，但是后来自己觉得不合适就来论坛问问~老师您第一段里说，如果讨论偶极矩，对于很大体系也得是讨论某个片段的局部偶极矩，那我可以取聚乙烯醇与界面接触的那一部分，但是这一部分具体什么构象我也不是很清楚，所以感觉取一部分算也不太好算。

所以，感觉要只有学一下第二段里的方法试试了。

sobereva · 发表于 Post on 2017-7-18 00:24:58

万卷书万里路发表于 2017-7-17 19:13
嗯嗯，谢谢Sob老师！
我一开始取了聚合度为20的一个片段计算，但是后来自己觉得不合适就来论坛问问~老师 ...

倒是可以跑跑分子动力学来帮助获得界面接触部分的构象，但如果觉得靠单个单体分子就能说明问题就没必要这样折腾了

万卷书万里路 · 发表于 Post on 2017-7-18 18:20:22

sobereva 发表于 2017-7-18 00:24
倒是可以跑跑分子动力学来帮助获得界面接触部分的构象，但如果觉得靠单个单体分子就能说明问题就没必要 ...

好，谢谢Sob老师！
我再想想怎么能说明问题。再找找文献资料。

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