柔性扫描与反应能量

长颈鹿先森 · 发表于 Post on 2017-10-17 11:12:10

“And these bond-cleavage reactions are determined as barrierless without transition states by relaxed-scan calculations at B3LYP/6-311G(d,p) level, with barrier heights of 66.1 kcal/mol, 63.6 kcal/mol and 72.9 kcal/mol respectively”，这是一篇文献中的一句话，作者说是通过柔性扫描的到无过渡态反应的反应能量，我不明白柔性扫描跟均裂反应的能量的关系。

sobereva · 发表于 Post on 2017-10-17 12:20:39

就是指柔性扫描已经扫到曲线成水平直线时候的能量和势能曲线最低点的能量差，并且在两点之间没有极大点

liyuanhe211 · 发表于 Post on 2017-10-17 12:21:07

阅读理解有误。是说用柔性扫描辅助说明没有过渡态，然后认为断键的自由能变是自由能垒。不是用柔性扫描算能量差

长颈鹿先森 · 发表于 Post on 2017-10-17 17:16:34

sobereva 发表于 2017-10-17 12:20
就是指柔性扫描已经扫到曲线成水平直线时候的能量和势能曲线最低点的能量差，并且在两点之间没有极大点

那sob老师您说的这个柔性扫描之后的能量差与将均裂的产物分别优化减去反应物获得的自由能量差，有什么区别，一般计算反应能量不是应该直接通过计算产物的能量与反应物能量的差值就行吗

sobereva · 发表于 Post on 2017-10-17 22:20:03

长颈鹿先森发表于 2017-10-17 17:16
那sob老师您说的这个柔性扫描之后的能量差与将均裂的产物分别优化减去反应物获得的自由能量差，有什么区 ...

原理上是一样的。
但原文里貌似并没有明确说额外做了“计算反应物能量”以及“单独计算两个裂解产物能量和”的步骤，所以很可能只是直接拿柔性扫描曲线的那两个点求差得到的

长颈鹿先森 · 发表于 Post on 2017-10-18 08:53:37

sobereva 发表于 2017-10-17 22:20
原理上是一样的。
但原文里貌似并没有明确说额外做了“计算反应物能量”以及“单独计算两个裂解产物能量 ...

谢谢老师

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