gmx energy计算能量的问题

1427437701 · 发表于 Post on 2017-11-20 20:24:38

gmx energy 计算出的能量是不是不具有代表性，我计算了两组物质，一组是带异种电荷的分子，一组是中性的分子，计算结果是中性分子之间的库伦作用比带异种电荷分子之间的库伦作用更强，如图红色曲线是中性分子之间的库伦作用，黑色曲线是带异种电荷分子之间的作用，请问这是怎么回事？是不是说gromacs计算出的数值不具有参考性？

1427437701 · 发表于 Post on 2017-11-21 08:34:56

问题已经解决，麻烦各位了！

jase20 · 发表于 Post on 2017-11-21 14:46:20

1427437701 发表于 2017-11-21 08:34
问题已经解决，麻烦各位了！

请问楼主是为什么呢？求详解

张雅琴 · 发表于 Post on 2017-11-22 15:34:36

中性分子整体不带电但是原子的点电荷有正负
是这个原因吗？

1427437701 · 发表于 Post on 2017-11-22 16:28:19

jase20 发表于 2017-11-21 14:46
请问楼主是为什么呢？求详解

跟计算的分子数有关，分子数越多数值越大。

1427437701 · 发表于 Post on 2017-11-22 16:28:54

张雅琴发表于 2017-11-22 15:34
中性分子整体不带电但是原子的点电荷有正负
是这个原因吗？

恩是的

daydayup · 发表于 Post on 2019-11-19 21:16:36

1427437701 发表于 2017-11-22 16:28
恩是的

楼主，可否能详细的说下是什么问题，后来怎么解决的呢？计算coul不能用g_energy吗？

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[GROMACS] gmx energy计算能量的问题

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