计算化学公社

 找回密码 Forget password
 注册 Register
Views: 10158|回复 Reply: 13
打印 Print 上一主题 Last thread 下一主题 Next thread

[Molcas] 请教Molcas问题

[复制链接 Copy URL]

47

帖子

0

威望

114

eV
积分
161

Level 3 能力者

跳转到指定楼层 Go to specific reply
楼主
用Molcas计算T1态跟基态的能量,能否直接用高斯下在T1态优化出来的结构作为初猜?

6万

帖子

99

威望

6万

eV
积分
125153

管理员

公社社长

2#
发表于 Post on 2018-3-14 11:20:32 | 只看该作者 Only view this author
语义不对
既然只是计算能量,初猜只能是对于波函数而言的,和结构扯不上关系。
Gaussian优化的结构可以在Molcas下算单点,或者优化时候作为初猜结构
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
欢迎加入北京科音微信公众号获取北京科音培训的最新消息,并避免错过网上有价值的计算化学文章!
欢迎加入人气极高、专业性特别强的理论与计算化学综合交流群思想家公社QQ群(群号见此链接),合计达一万多人。北京科音培训班的学员在群中可申请VIP头衔,提问将得到群主Sobereva的最优先解答。
思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大、极为流行的量子化学波函数分析程序)
Google Scholar:https://scholar.google.com/citations?user=tiKE0qkAAAAJ
ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu

47

帖子

0

威望

114

eV
积分
161

Level 3 能力者

3#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2018-3-14 11:51:10 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2018-3-14 11:20
语义不对
既然只是计算能量,初猜只能是对于波函数而言的,和结构扯不上关系。
Gaussian优化的结构可以在 ...

但是在molcas计算需要确定活性区间那些,有了轨道信息才能最后做单点计算不是?还是说我直接确定轨道信息后直接做单点后即可,无需再做优化?如果我在高斯下已经计算得到稳定的结构,那我要得到这个结构在基态和T1态的能量,那我是不是还要继续做优化与频率计算,那这时候我如果用的初猜结构的高斯下计算得到的T1的结构是不是会有影响?

6万

帖子

99

威望

6万

eV
积分
125153

管理员

公社社长

4#
发表于 Post on 2018-3-14 12:21:08 | 只看该作者 Only view this author
你既可以用molcas计算单点,也可以用molcas优化结构,无论哪种你都得定义活性空间。
是否要进一步用molcas优化结构完全取决于你,如果你在molcas下用的级别和高斯之前优化用的级别都一样,或者高斯下优化时候用的级别对于你当前的研究已经够了,那就没有必要再优化。
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
欢迎加入北京科音微信公众号获取北京科音培训的最新消息,并避免错过网上有价值的计算化学文章!
欢迎加入人气极高、专业性特别强的理论与计算化学综合交流群思想家公社QQ群(群号见此链接),合计达一万多人。北京科音培训班的学员在群中可申请VIP头衔,提问将得到群主Sobereva的最优先解答。
思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大、极为流行的量子化学波函数分析程序)
Google Scholar:https://scholar.google.com/citations?user=tiKE0qkAAAAJ
ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu

47

帖子

0

威望

114

eV
积分
161

Level 3 能力者

5#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2018-3-14 15:27:14 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2018-3-14 12:21
你既可以用molcas计算单点,也可以用molcas优化结构,无论哪种你都得定义活性空间。
是否要进一步用molcas ...

好的,明白了,谢谢老师。

47

帖子

0

威望

114

eV
积分
161

Level 3 能力者

6#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2018-3-14 15:42:40 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2018-3-14 12:21
你既可以用molcas计算单点,也可以用molcas优化结构,无论哪种你都得定义活性空间。
是否要进一步用molcas ...

老师,我还有一个问题,就是我要算T1态的能量,那我是不是可以直接把在高斯下优化得到的T1态结构直接拿来Molcas下做单点?

273

帖子

0

威望

4430

eV
积分
4703

Level 6 (一方通行)

7#
发表于 Post on 2018-3-14 16:17:27 | 只看该作者 Only view this author
有点小冒失 发表于 2018-3-14 15:42
老师,我还有一个问题,就是我要算T1态的能量,那我是不是可以直接把在高斯下优化得到的T1态结构直接拿来 ...

两种软件的计算结果差异可能会很大,不可以

47

帖子

0

威望

114

eV
积分
161

Level 3 能力者

8#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2018-3-14 16:21:46 | 只看该作者 Only view this author
函数与激情 发表于 2018-3-14 16:17
两种软件的计算结果差异可能会很大,不可以

不能直接拿来做单点计算么

6万

帖子

99

威望

6万

eV
积分
125153

管理员

公社社长

9#
发表于 Post on 2018-3-14 21:14:05 | 只看该作者 Only view this author
有点小冒失 发表于 2018-3-14 15:42
老师,我还有一个问题,就是我要算T1态的能量,那我是不是可以直接把在高斯下优化得到的T1态结构直接拿来 ...

可以。但前提肯定是因为Gaussian不支持(或不擅长)你算单点要用的级别,于是在MOLCAS里用的是与Gaussian优化时不同的级别来计算单点。优化和单点计算不用同一个级别,或者不用同一个程序,是非常正常的情况,此做法没有任何不合理性。
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
欢迎加入北京科音微信公众号获取北京科音培训的最新消息,并避免错过网上有价值的计算化学文章!
欢迎加入人气极高、专业性特别强的理论与计算化学综合交流群思想家公社QQ群(群号见此链接),合计达一万多人。北京科音培训班的学员在群中可申请VIP头衔,提问将得到群主Sobereva的最优先解答。
思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大、极为流行的量子化学波函数分析程序)
Google Scholar:https://scholar.google.com/citations?user=tiKE0qkAAAAJ
ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu

273

帖子

0

威望

4430

eV
积分
4703

Level 6 (一方通行)

10#
发表于 Post on 2018-3-15 08:56:19 | 只看该作者 Only view this author
有点小冒失 发表于 2018-3-14 16:21
不能直接拿来做单点计算么

就我个人而言,我有时DFT和MOLCAS同一个体系T1态优化出来不一样

47

帖子

0

威望

114

eV
积分
161

Level 3 能力者

11#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2018-3-18 14:12:50 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2018-3-14 21:14
可以。但前提肯定是因为Gaussian不支持(或不擅长)你算单点要用的级别,于是在MOLCAS里用的是与Gaussian ...

好的,谢谢sob老师。那如果是我要在molacas下优化一个结构,用在高斯下优化基态得到的稳定结构作为在molcas下优化基态跟T1态的初猜一直出现优化不收敛的情况,而如果用高斯下优化T1态得到的稳定结构做为molcas的初猜就可以优化得到正常结果,像这样子把高斯下T1态的结构拿来作为molcas下优化基态跟T1态的初猜这样子可行不?

47

帖子

0

威望

114

eV
积分
161

Level 3 能力者

12#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2018-3-18 14:26:51 | 只看该作者 Only view this author
函数与激情 发表于 2018-3-15 08:56
就我个人而言,我有时DFT和MOLCAS同一个体系T1态优化出来不一样

恩呢,我算了一个基态的也是不一样的结果

6万

帖子

99

威望

6万

eV
积分
125153

管理员

公社社长

13#
发表于 Post on 2018-3-18 16:22:56 | 只看该作者 Only view this author
有点小冒失 发表于 2018-3-18 14:12
好的,谢谢sob老师。那如果是我要在molacas下优化一个结构,用在高斯下优化基态得到的稳定结构作为在molc ...

北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
欢迎加入北京科音微信公众号获取北京科音培训的最新消息,并避免错过网上有价值的计算化学文章!
欢迎加入人气极高、专业性特别强的理论与计算化学综合交流群思想家公社QQ群(群号见此链接),合计达一万多人。北京科音培训班的学员在群中可申请VIP头衔,提问将得到群主Sobereva的最优先解答。
思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大、极为流行的量子化学波函数分析程序)
Google Scholar:https://scholar.google.com/citations?user=tiKE0qkAAAAJ
ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu

47

帖子

0

威望

114

eV
积分
161

Level 3 能力者

14#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2018-3-19 15:16:12 | 只看该作者 Only view this author

本版积分规则 Credits rule

手机版 Mobile version|北京科音自然科学研究中心 Beijing Kein Research Center for Natural Sciences|京公网安备 11010502035419号|计算化学公社 — 北京科音旗下高水平计算化学交流论坛 ( 京ICP备14038949号-1 )|网站地图

GMT+8, 2026-2-23 19:19 , Processed in 0.179448 second(s), 20 queries , Gzip On.

快速回复 返回顶部 返回列表 Return to list